RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466964.1

LAMC1-202, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 4

Gene LAMC1, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-202ENST00000466964 STAG3L1P0CL83 205 aa11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 TECP42680 631 aa11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ANGPT1Q15389 498 aa11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 TICAM2Q86XR7 235 aa11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 NECTIN4Q96NY8 510 aa11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ADAM7Q9H2U9 754 aa11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 CWH43Q9H720 699 aa11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 HCSTQ9UBK5 93 aa11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 TUBE1Q9UJT0 475 aa11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 PADI3Q9ULW8 664 aa11.94□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 A0A0D9SFI3 127 aa11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 HIDE1A8MVS5 230 aa11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 NOP56O00567 594 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ZBTB5O15062 677 aa11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 FIBPO43427 364 aa11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ITIH3Q06033 890 aa11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 GRIK4Q16099 956 aa11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 TOMM22Q9NS69 142 aa11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 USTQ9Y2C2 406 aa11.93□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 MGEA5O60502 916 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 LMNAP02545 664 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ASGR2P07307 311 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 SRGAP2BP0DMP2 458 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 SP100P23497 879 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 HAND2P61296 217 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 PPFIA1Q13136 1202 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 GNPTABQ3T906 1256 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ZBTB33Q86T24 672 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 RSPH3Q86UC2 560 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 MIER1Q8N108 512 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ESR2Q92731 530 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 FAM227BQ96M60 508 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa11.92□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 C2orf16Q68DN1 1984 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 C9IYK1 514 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 PPFIA3O75145 1194 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 KCNA2P16389 499 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 FAM189BP81408 668 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 CCDC178Q5BJE1 867 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 DTWD2Q8NBA8 298 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 CASP10Q92851 521 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 PCYT2Q99447 389 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 RIOX1Q9H6W3 641 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.91□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 POLR2MP0CAP2 368 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 MX1P20591 662 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 APOBRQ0VD83 1088 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 KIAA1841Q6NSI8 718 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 LRRC55Q6ZSA7 311 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 FEZF2Q8TBJ5 459 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 RTP3Q9BQQ7 232 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 APOL5Q9BWW9 433 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 AAASQ9NRG9 546 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 RGS18Q9NS28 235 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 RNF19AQ9NV58 838 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 TMEM260Q9NX78 707 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ERAP1Q9NZ08 941 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 TRPV2Q9Y5S1 764 aa11.9□□□□□ -0.5
LAMC1-202ENST00000466964 CYTH3O43739 400 aa11.89□□□□□ -0.51
LAMC1-202ENST00000466964 ATP9AO75110 1047 aa11.89□□□□□ -0.51
LAMC1-202ENST00000466964 EOMESO95936 686 aa11.89□□□□□ -0.51
LAMC1-202ENST00000466964 MTHFRP42898 656 aa11.89□□□□□ -0.51
LAMC1-202ENST00000466964 SEC23AQ15436 765 aa11.89□□□□□ -0.51
LAMC1-202ENST00000466964 IER5Q5VY09 327 aa11.89□□□□□ -0.51
LAMC1-202ENST00000466964 PLPP4Q5VZY2 271 aa11.89□□□□□ -0.51
LAMC1-202ENST00000466964 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms