RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	EMSY	Q7Z589	1322 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	HAS3	O00219	553 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	MED24	O75448	989 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	F2	P00734	622 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	OAT	P04181	439 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	COL6A1	P12109	1028 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	INSRR	P14616	1297 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	RPA1	P27694	616 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	TXLNA	P40222	546 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	PRKCE	Q02156	737 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	PPFIA1	Q13136	1202 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	PTGIS	Q16647	500 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	MTERF2	Q49AM1	385 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	XKR9	Q5GH70	373 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	XKR3	Q5GH77	459 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	C4orf19	Q8IY42	314 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	EPSTI1	Q96J88	318 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	FAM167A	Q96KS9	214 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	CEP170P1	Q96L14	293 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	NACC1	Q96RE7	527 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	LXN	Q9BS40	222 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	DNM3	Q9UQ16	869 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	PCNT	O95613	3336 aa		9.35	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	GRIN2D	O15399	1336 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	ZBTB39	O15060	712 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	ZNF862	O60290	1169 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	EVI5	O60447	810 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	KLRC1	P26715	233 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	CDK7	P50613	346 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	NPEPPS	P55786	919 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	RTP1	P59025	263 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	TLE2	Q04725	743 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	GRIK4	Q16099	956 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	TRIM60	Q495X7	471 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	METTL13	Q8N6R0	699 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		9.34	□□□□□ -0.91
IL6-208	ENST00000464710	NRCAM	Q92823	1304 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	TMEM150B	A6NC51	233 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710		E9PMD0	336 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	TREH	O43280	583 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	CYP2C9	P11712	490 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	ECM1	Q16610	540 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	ADAL	Q6DHV7	355 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	POTEG	Q6S5H5	508 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	USP49	Q70CQ1	688 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	PDILT	Q8N807	584 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	RETREG2	Q8NC44	543 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		9.33	□□□□□ -0.92
IL6-208	ENST00000464710	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		9.33	□□□□□ -0.92

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