RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM50Q86XT4 487 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 C7orf31Q8N865 590 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB34Q9BZG1 259 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 EML1O00423 815 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 PDIA5Q14554 519 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP6V0A1Q93050 837 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 ZDHHC9Q9Y397 364 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 CLIC4Q9Y696 253 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 STK24Q9Y6E0 443 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAH12Q6ZR08 3092 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-205ENST00000450873 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 P4HBP07237 508 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 MFSD5Q6N075 450 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 NEK9Q8TD19 979 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 USP28Q96RU2 1077 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 MARK3P27448 753 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 PSMC5P62195 406 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 PLCB4Q15147 1175 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM126BQ8IXS8 530 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 CKAP2LQ8IYA6 745 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 ERMNQ8TAM6 284 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM167AQ96KS9 214 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 POTEB3A0JP26 581 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 HBP1O60381 514 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 GNAT1P11488 350 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 QARSP47897 775 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 NASPP49321 788 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPAQ15257 358 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 POTEBQ6S5H4 581 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP8B4Q8TF62 1192 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 NRBP2Q9NSY0 501 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP45Q9UL16 551 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 POTEMA6NI47 508 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 CD4P01730 458 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC39A14Q15043 492 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 IL17AQ16552 155 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 IGSF22Q8N9C0 903 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 HSD17B14Q9BPX1 270 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 LRWD1Q9UFC0 647 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 TRPC6Q9Y210 931 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 NRCAMQ92823 1304 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 VWA3AA6NCI4 1184 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 YEATS4O95619 227 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP4AP20648 1035 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 PPFIA1Q13136 1202 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 STK38Q15208 465 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 UGCGQ16739 394 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM199Q8N511 208 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 BANK1Q8NDB2 785 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 DYDC2Q96IM9 177 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 32.1
RABGEF1-205ENST00000450873 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 COL6A3P12111 3177 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF862O60290 1169 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 SLITRK3O94933 977 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 OATP04181 439 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 INSRRP14616 1297 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 HOXC8P31273 242 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 PRKCEQ02156 737 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 XKR3Q5GH77 459 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF484Q5JVG2 852 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 HAUS3Q68CZ6 603 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 TPH2Q8IWU9 490 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 C4orf19Q8IY42 314 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00301Q8NCQ3 95 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms