RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445181.5

C9orf3-207, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 873 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-207ENST00000445181 IGBP1P78318 339 aa27■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 GRIN2CQ14957 1233 aa27■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 PLCB4Q15147 1175 aa27■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 RAB30Q15771 203 aa27■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 GRIK4Q16099 956 aa27■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 MIER3Q7Z3K6 550 aa27■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 GABBR1Q9UBS5 961 aa27■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 KAT6AQ92794 2004 aa27■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
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C9orf3-207ENST00000445181 POTEB3A0JP26 581 aa26.99■■□□□ 1.91
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C9orf3-207ENST00000445181 SELPP16109 830 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 POTEBQ6S5H4 581 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 SERINC5Q86VE9 423 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 SLFN12Q8IYM2 578 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 NEMFO60524 1076 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 INSRRP14616 1297 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 RBL2Q08999 1139 aa26.98■■□□□ 1.91
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C9orf3-207ENST00000445181 HSCBQ8IWL3 235 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 RRN3P2A6NIE6 340 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 CKBP12277 381 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 FOSL2P15408 326 aa26.97■■□□□ 1.91
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C9orf3-207ENST00000445181 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.913e-8■□□□□ 10.4
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C9orf3-207ENST00000445181 THPOP40225 353 aa26.97■■□□□ 1.91
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C9orf3-207ENST00000445181 LRRC8DQ7L1W4 858 aa26.97■■□□□ 1.91
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C9orf3-207ENST00000445181 ATP8B4Q8TF62 1192 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 HAS1Q92839 578 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 SNX21Q969T3 373 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
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C9orf3-207ENST00000445181 WNT8BQ93098 351 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf3-207ENST00000445181 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.96■■□□□ 1.91
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C9orf3-207ENST00000445181 GPNMBQ14956 572 aa26.95■■□□□ 1.9
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C9orf3-207ENST00000445181 VAV3Q9UKW4 847 aa26.95■■□□□ 1.9
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C9orf3-207ENST00000445181 SLC28A3Q9HAS3 691 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 ATP4AP20648 1035 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 PDCP20941 246 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 TXKP42681 527 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 ZNF618Q5T7W0 954 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 TAF2Q6P1X5 1199 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 PCDHA12Q9UN75 941 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 MYOGP15173 224 aa26.92■■□□□ 1.9
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C9orf3-207ENST00000445181 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 UGCGQ16739 394 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 ZNF484Q5JVG2 852 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 MARCH8Q5T0T0 291 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 RUFY4Q6ZNE9 571 aa26.92■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 RSPH3Q86UC2 560 aa26.92■■□□□ 1.9
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C9orf3-207ENST00000445181 NBNO60934 754 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 BAIAP3O94812 1187 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 OATP04181 439 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 CTSHP09668 335 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 RSPH10BP0C881 870 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 TRAF7Q6Q0C0 670 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 BANK1Q8NDB2 785 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 ZBTB10Q96DT7 871 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 SLC9A7Q96T83 725 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 PRDM12Q9H4Q4 367 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 COL1A2P08123 1366 aa26.91■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
C9orf3-207ENST00000445181 CAND2O75155 1236 aa26.9■■□□□ 1.9
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