RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF862O60290 1169 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HBP1O60381 514 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CAND2O75155 1236 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PARNO95453 639 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTSHP09668 335 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TAF2Q6P1X5 1199 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPAINQ86UA6 219 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 GRXCR1A8MXD5 290 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF28PB7ZC32 967 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBX3O15119 743 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPR153Q6NV75 609 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MIER3Q7Z3K6 550 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EML1O00423 815 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP2R5CQ13362 524 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM26DQ5JW98 314 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTHFD1LQ6UB35 978 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 RDM1Q8NG50 284 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DNAJB3Q8WWF6 145 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHRNA1P02708 482 aa28.16■■■□□ 2.1
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC34A2O95436 690 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACTN1P12814 892 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GJB2P29033 226 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MGAT3Q09327 533 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF484Q5JVG2 852 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q7L0L9 218 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL1A2P08123 1366 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP2B1P20020 1258 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLRC1P26715 233 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRKCEQ02156 737 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPIRE1Q08AE8 756 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNKSR3Q6P9H4 555 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NOSTRINQ8IVI9 506 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KAT6AQ92794 2004 aa28.14■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STBD1O95210 358 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OATP04181 439 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTMR9Q96QG7 549 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BAIAP3O94812 1187 aa28.12■■■□□ 2.09
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 DBF4BQ8NFT6 615 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM167AQ96KS9 214 aa28.12■■■□□ 2.09
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM60Q9H2L4 133 aa28.12■■■□□ 2.09
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 DEFB123Q8N688 67 aa28.11■■■□□ 2.09
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF3AQ9Y496 699 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDY2AQ9Y6F7 541 aa28.11■■■□□ 2.09
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR81Q562E7 1941 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDH23Q9H251 3354 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GHRP10912 638 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSMC5P62195 406 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBR1Q14596 966 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LPIN1Q14693 890 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EPHA7Q15375 998 aa28.08■■■□□ 2.09
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