RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 CAND2O75155 1236 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 RSPH10BP0C881 870 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 PPP2R5CQ13362 524 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 GPNMBQ14956 572 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 CALCRLQ16602 461 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 UGCGQ16739 394 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 HERVK_113Q902F9 699 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 LRCH3Q96II8 777 aa20.31■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 EML1O00423 815 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 ZNF862O60290 1169 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 NBNO60934 754 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 CTSHP09668 335 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 MCM7P33993 719 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 RASIP1Q5U651 963 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 FAM167AQ96KS9 214 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 COL1A2P08123 1366 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.3■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 H3BQV1 296 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 OATP04181 439 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 MBTPS1Q14703 1052 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 MCTP1Q6DN14 999 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 RPAINQ86UA6 219 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 RSPH3Q86UC2 560 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.29■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 ZBBXA8MT70 800 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 CXCL10P02778 98 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 ACTN1P12814 892 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 KLRC1P26715 233 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 PRKCEQ02156 737 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 ZNF174Q15697 407 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 TTC38Q5R3I4 469 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 BANK1Q8NDB2 785 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 MTMR9Q96QG7 549 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.28■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 TXKP42681 527 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 TRAPPC10P48553 1259 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 FAM26DQ5JW98 314 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 SCN5AQ14524 2016 aa20.27■□□□□ 0.84
HERC3-205ENST00000426683 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 PSMC5P62195 406 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 MGAT3Q09327 533 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 EPHA7Q15375 998 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 SNX21Q969T3 373 aa20.26■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 C22orf31O95567 290 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 CHRNA1P02708 482 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 NBR1Q14596 966 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 XKR3Q5GH77 459 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.25■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 BAIAP3O94812 1187 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 STBD1O95210 358 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 OR52Z1P0C646 297 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 TCTN1Q2MV58 587 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 IER5Q5VY09 327 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.24■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 TMEM150BA6NC51 233 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 M0QZ92 97 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 MAGEB2O15479 319 aa20.23■□□□□ 0.83
HERC3-205ENST00000426683 MTERF2Q49AM1 385 aa20.23■□□□□ 0.83
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