RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.21■■□□□ 1.15
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HOXD12-201ENST00000404162 FGF18O76093 207 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 TECP42680 631 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 LNPKQ9C0E8 428 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 SENP2Q9HC62 589 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 TRPC6Q9Y210 931 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.2■■□□□ 1.14
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HOXD12-201ENST00000404162 FSCN2O14926 492 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 PAK2Q13177 524 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXD12-201ENST00000404162 PCYT2Q99447 389 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXD12-201ENST00000404162 MGEA5O60502 916 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 NBL1P41271 181 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
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HOXD12-201ENST00000404162 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.18■■□□□ 1.14
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HOXD12-201ENST00000404162 TMEM260Q9NX78 707 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 CDH22Q9UJ99 828 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 M0QZ92 97 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 ITGB5P18084 799 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 AAASQ9NRG9 546 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 FSD2A1L4K1 749 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 BRD1O95696 1058 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 TROAPQ12815 778 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 CUL5Q93034 780 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
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HOXD12-201ENST00000404162 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22.15■■□□□ 1.14
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HOXD12-201ENST00000404162 CWH43Q9H720 699 aa22.15■■□□□ 1.14
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HOXD12-201ENST00000404162 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD12-201ENST00000404162 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.14■■□□□ 1.14
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HOXD12-201ENST00000404162 KRT76Q01546 638 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 IL25Q9H293 177 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 HIDE1A8MVS5 230 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 ID4P47928 161 aa22.13■■□□□ 1.13
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HOXD12-201ENST00000404162 PLCB4Q15147 1175 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.13■■□□□ 1.13
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HOXD12-201ENST00000404162 ADAM2Q99965 735 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 TCF25Q9BQ70 676 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 POMKQ9H5K3 350 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 RGS18Q9NS28 235 aa22.13■■□□□ 1.13
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HOXD12-201ENST00000404162 NR2E1Q9Y466 385 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 VPS13AQ96RL7 3174 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 MTMR1Q13613 665 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 NME8Q8N427 588 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 GINS2Q9Y248 185 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 C9IYK1 514 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 FGFR1P11362 822 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 PLCB3Q01970 1234 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 WTAPQ15007 396 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD12-201ENST00000404162 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.11■■□□□ 1.13
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