RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 STAT2P52630 851 aa25.33■■□□□ 1.64
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RABGGTA-202ENST00000399409 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa25.32■■□□□ 1.64
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RABGGTA-202ENST00000399409 GOPCQ9HD26 462 aa25.31■■□□□ 1.64
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RABGGTA-202ENST00000399409 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
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RABGGTA-202ENST00000399409 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
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RABGGTA-202ENST00000399409 SLC35C1Q96A29 364 aa25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-202ENST00000399409 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-202ENST00000399409 WDR18Q9BV38 432 aa25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-202ENST00000399409 EHD2Q9NZN4 543 aa25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RABGGTA-202ENST00000399409 CLSTN1O94985 981 aa25.27■■□□□ 1.64
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