RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 AMY2BP19961 511 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 RRADP55042 308 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 HERVK_113P62684 666 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 IL13RA1P78552 427 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 PTPRN2Q92932 1015 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 FBXW5Q969U6 566 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 WNK4Q96J92 1243 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 INCENPQ9NQS7 918 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 GALNT8Q9NY28 637 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 HMGCRP04035 888 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 AOAHP28039 575 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 TBR1Q16650 682 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 CFHR4Q92496 578 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 OR14A2Q96R54 314 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 BTBD7Q9P203 1132 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 ARVCFO00192 962 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 PDE6AP16499 860 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 NAT1P18440 290 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 ACRV1P26436 265 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 MCM7P33993 719 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 BTBD2Q9BX70 525 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 CSRNP2Q9H175 543 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 ADCY3O60266 1144 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 DPTQ07507 201 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 USP30Q70CQ3 517 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 OSTM1Q86WC4 334 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 IL17DQ8TAD2 202 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 CHFRQ96EP1 664 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 CBLCQ9ULV8 474 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-202ENST00000368205 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 GSTA4O15217 222 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 MPIG6BO95866 241 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 PYGMP11217 842 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 KCNQ1P51787 676 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 FOXL1Q12952 345 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 KANK2Q63ZY3 851 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 NELFAQ9H3P2 528 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 NISCHQ9Y2I1 1504 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 C1SP09871 688 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 MC4RP32245 332 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 ADCY8P40145 1251 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 JAM2P57087 298 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 DGCR2P98153 550 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 GUCY1A3Q02108 690 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 PCOLCEQ15113 449 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 CRY1Q16526 586 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 SPATC1Q76KD6 591 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 AMNQ9BXJ7 453 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 OR10A2Q9H208 303 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 A0A0G2JNJ9 132 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 PDPK1O15530 556 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 ECE1P42892 770 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 INHBEP58166 350 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 GABREP78334 506 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 ST5P78524 1137 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 RASGRF1Q13972 1273 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-202ENST00000368205 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.25□□□□□ -1.41
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