RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 DNAJC19Q96DA6 116 aa19.8■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 ZHX3Q9H4I2 956 aa19.8■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 ZNF302Q9NR11 478 aa19.8■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 ARHGAP1Q07960 439 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 CCDC144BQ3MJ40 725 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 C4orf19Q8IY42 314 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 AOPEPQ8N6M6 819 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 GPR20Q99678 358 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 REEP2Q9BRK0 252 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 ADCY6O43306 1168 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 ATG7O95352 703 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 LYPLA2O95372 231 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 GH1P01241 217 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 CD44P16070 742 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 SMPD1P17405 629 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 OLFML2BQ68BL8 750 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 KLHL10Q6JEL2 608 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 RINT1Q6NUQ1 792 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 UNC13DQ70J99 1090 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 TRIM50Q86XT4 487 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 SEPT1Q8WYJ6 367 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 PCYT2Q99447 389 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 CFHR5Q9BXR6 569 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 TSKSQ9UJT2 592 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa19.79■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 NPEPPSP55786 919 aa19.78■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 KCNB1Q14721 858 aa19.78■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 PANK4Q9NVE7 773 aa19.78■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 RSPH10B2B2RC85 870 aa19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 GPR25O00155 361 aa19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 USO1O60763 962 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 RHOBTB3O94955 611 aa19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 RSPH10BP0C881 870 aa19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 COASYQ13057 564 aa19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 GIT2Q14161 759 aa19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 XKR9Q5GH70 373 aa19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 ANO5Q75V66 913 aa19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 MAEAQ7L5Y9 396 aa19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 KCTD17Q8N5Z5 321 aa19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 TBC1D7Q9P0N9 293 aa19.77■□□□□ 0.76
LTV1-201ENST00000367576 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 RARRES1P49788 294 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 CNNM4Q6P4Q7 775 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 PADI6Q6TGC4 694 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 C1orf186Q6ZWK4 172 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 MLKLQ8NB16 471 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 TRIB2Q92519 343 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 SLC39A2Q9NP94 309 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 STBD1O95210 358 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 ATP4AP20648 1035 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 MARK3P27448 753 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 MRE11P49959 708 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 TNFAIP2Q03169 654 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 IQCB1Q15051 598 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 DUSP28Q4G0W2 176 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 FAM160B1Q5W0V3 765 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 CCDC65Q8IXS2 484 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 OR6J1Q8NGC5 347 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 AFG1LQ8WV93 481 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 GLG1Q92896 1179 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 CTNND2Q9UQB3 1225 aa19.76■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa19.75■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP19.75■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 TBCAO75347 108 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 STAT5BP51692 787 aa19.75■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 STK4Q13043 487 aa19.75■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 LAMC2Q13753 1193 aa19.75■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 CEP170P1Q96L14 293 aa19.75■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 AZI2Q9H6S1 392 aa19.75■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 ANKEF1Q9NU02 776 aa19.75■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 DACH1Q9UI36 760 aa19.75■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 SFI1A8K8P3 1242 aa19.74■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 OATP04181 439 aa19.74■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 ELNP15502 786 aa19.74■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 HSPA6P17066 643 aa19.74■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 STX17P56962 302 aa19.74■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 TRIM32Q13049 653 aa19.74■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 MTERF2Q49AM1 385 aa19.74■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 IQSEC1Q6DN90 963 aa19.74■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 SFR1Q86XK3 245 aa19.74■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 KIAA0895Q8NCT3 520 aa19.74■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 GLIS3Q8NEA6 775 aa19.74■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa19.74■□□□□ 0.75
LTV1-201ENST00000367576 BECN2A8MW95 431 aa19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85 ms