RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SFI1A8K8P3 1242 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 XXYLT1Q8NBI6 393 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CEP95Q96GE4 821 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 MT-ND3P03897 115 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 DR1Q01658 176 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 ALS2CLQ60I27 953 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 FAM167AQ96KS9 214 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PDIK1LQ8N165 341 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L15C9J2P7 530 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L11C9JVI0 530 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L18D6R9N7 530 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L22D6RA61 530 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L19D6RCP7 530 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L20D6RJB6 530 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L24Q0WX57 530 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 ERICH1Q86X53 443 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 Q9H521 79 aa21.84■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 RASGRF2O14827 1237 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PRELPP51888 382 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 GRM4Q14833 912 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 EMBQ6PCB8 327 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 PIM2Q9P1W9 311 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CEP72Q9P209 647 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 IFT88Q13099 833 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1841Q6NSI8 718 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 KRT76Q01546 638 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 MCUQ8NE86 351 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CPVLQ9H3G5 476 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 TLK1Q9UKI8 766 aa21.83■■□□□ 1.09
CCSAP-203ENST00000366687 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 XPAP23025 273 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 STXBP2Q15833 593 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SFR1Q86XK3 245 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 FEM1BQ9UK73 627 aa21.83■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 CUL1Q13616 776 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TMED2Q15363 201 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 NR3C1P04150 777 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 CPDO75976 1380 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ATP8B3O60423 1300 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 PADI6Q6TGC4 694 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 OXER1Q8TDS5 423 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 GBP5Q96PP8 586 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TET3O43151 1660 aa21.82■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 S100BP04271 92 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN3O15551 220 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA3FQ13275 785 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 NNTQ13423 1086 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 BBS9Q3SYG4 887 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 RAD54LQ92698 747 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 BARHL2Q9NY43 387 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 USP17L10C9JJH3 530 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 ZBED1O96006 694 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 STX1BP61266 288 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 CASP8Q14790 479 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 MAPK6Q16659 721 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 PCGF5Q86SE9 256 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.81■■□□□ 1.08
CCSAP-203ENST00000366687 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms