RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365602.1

RNA5SP248-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 248, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP248, Length 127 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP248-201ENST00000365602 MTFR1Q15390 333 aa14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 KCNA10Q16322 511 aa14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 SV2BQ7L1I2 683 aa14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 DHX58Q96C10 678 aa14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 PLIN2Q99541 437 aa14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 TRPC6Q9Y210 931 aa14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 HPSEQ9Y251 543 aa14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 PPME1Q9Y570 386 aa14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 MCM3APO60318 1980 aa14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.61□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 POTEB3A0JP26 581 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 HBP1O60381 514 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 ADAMTS4O75173 837 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 ZNF202O95125 648 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 SGPL1O95470 568 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 OATP04181 439 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 GNAT1P11488 350 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 PLCG1P19174 1290 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 PRKCEQ02156 737 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 LRRC41Q15345 812 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 POTEBQ6S5H4 581 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 USP49Q70CQ1 688 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 CNNM3Q8NE01 707 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 TIGD1Q96MW7 591 aa14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 POTEFA5A3E0 1075 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 DNM1LO00429 736 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 EYA4O95677 639 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 ASGR1P07306 291 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 SLFN14P0C7P3 912 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 MARK3P27448 753 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 CHMP4BP1P59074 171 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 GRB10Q13322 594 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 XKR9Q5GH70 373 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 POTEGQ6S5H5 508 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 C7orf31Q8N865 590 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 CEP170P1Q96L14 293 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 PNMA5Q96PV4 448 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 PCYT2Q99447 389 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.59□□□□□ -0.07
RNA5SP248-201ENST00000365602 F2P00734 622 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 PLA2G4BP0C869 781 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 ZNF286BP0CG31 522 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 PTGS1P23219 599 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 PSEN2P49810 448 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 ACLYP53396 1101 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 MFSD10Q14728 455 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 NFKBIBQ15653 356 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 RAD54LQ92698 747 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 TNMDQ9H2S6 317 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 KCND2Q9NZV8 630 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.58□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 E9PMD0 336 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 CTAGE5O15320 804 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 NR1I2O75469 434 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 MYL1P05976 194 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 RFC5P40937 340 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 GJA8P48165 433 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 PLCB4Q15147 1175 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 ECM1Q16610 540 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 UGCGQ16739 394 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 LONRF3Q496Y0 759 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 TRIM50Q86XT4 487 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 RETREG2Q8NC44 543 aa14.57□□□□□ -0.08
RNA5SP248-201ENST00000365602 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms