RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LIG4P49917 911 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RWDD2BP57060 319 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FOXI1Q12951 378 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SETDB1Q15047 1291 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VPS72Q15906 364 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC35G1Q2M3R5 365 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF425Q6IV72 752 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RCSD1Q6JBY9 416 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q6ZR03 302 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZDHHC22Q8N966 263 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PJA1Q8NG27 643 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZFP28Q8NHY6 868 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STON2Q8WXE9 905 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUSD3Q96L08 255 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 L2HGDHQ9H9P8 463 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDLIM7Q9NR12 457 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATG3Q9NT62 314 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GJB4Q9NTQ9 266 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GAKO14976 1311 aa-2.78□□□□□ -2.85
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP-2.78□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SIP14410 1827 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 K7EP34 96 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EYA2O00167 538 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LDB3O75112 727 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UMODP07911 640 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYOD1P15172 320 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CXCR3P49682 368 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TKTL1P51854 596 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PAX2Q02962 417 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 REG3AQ06141 175 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STRN3Q13033 797 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DEFB112Q30KQ8 113 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ALS2CLQ60I27 953 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCARA3Q6AZY7 606 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR73Q6P4I2 378 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF144BQ7Z419 303 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MARCH9Q86YJ5 346 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF683Q8IZ20 524 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF101Q8IZC7 436 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PROM2Q8N271 834 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VGLL2Q8N8G2 317 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAJB8Q8NHS0 232 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC45A3Q96JT2 553 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LATS2Q9NRM7 1088 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC7A10Q9NS82 523 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM35Q9UPQ4 493 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNH4Q9UQ05 1017 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C22orf24Q9Y442 160 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RP1P56715 2156 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa-2.79□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP-2.79□□□□□ -2.86
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RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM38O00635 465 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MATN3O15232 486 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IRAK2O43187 625 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPFIA3O75145 1194 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP6R2O75170 966 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 F2P00734 622 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD5P06127 495 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NR1D1P20393 614 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MDKP21741 143 aaPredicted RBP-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHRNA5P30532 468 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 THBS4P35443 961 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACVRL1P37023 503 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF136P52737 540 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HEPACAMQ14CZ8 416 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTPN21Q16825 1174 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DOK7Q18PE1 504 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MANEALQ5VSG8 457 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FNDC7Q5VTL7 733 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C19orf48Q6RUI8 117 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CYS1Q717R9 158 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RASGRP4Q8TDF6 673 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CPT1BQ92523 772 aa-2.8□□□□□ -2.86
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