RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CLCN3P51790 818 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 GRM4Q14833 912 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC181Q5TID7 509 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 IL17RAQ96F46 866 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ADAM2Q99965 735 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
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PTPRC-201ENST00000348564 KCNH7Q9NS40 1196 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 B3GAT3O94766 335 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
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