RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 SLFN11Q7Z7L1 901 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 RASGEF1CQ8N431 466 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 METTL13Q8N6R0 699 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CCT6BQ92526 530 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 LRRC27Q9C0I9 530 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CENPHQ9H3R5 247 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 GOLPH3Q9H4A6 298 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 STX8Q9UNK0 236 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 MTMR7Q9Y216 660 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CEP83Q9Y592 693 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 IRS2Q9Y4H2 1338 aa9.28□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 FOCADQ5VW36 1801 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CEP104O60308 925 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TDP2O95551 362 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 GNA14O95837 355 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 GHRP10912 638 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 PDHBP11177 359 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 DRD4P21917 467 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SCTRP47872 440 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 RPS8P62241 208 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 PTK2Q05397 1052 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 P3H4Q92791 437 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TLCD1Q96CP7 247 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 KCTD10Q9H3F6 313 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 KANSL2Q9H9L4 492 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 MKNK2Q9HBH9 465 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 F8VZ95 297 aa9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 F8W031 263 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 DAPK3O43293 454 aa9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 CDR1P51861 262 aa9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 ARID5AQ03989 594 aa9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 PIGSQ96S52 555 aa9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 NAGPAQ9UK23 515 aa9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 SUFUQ9UMX1 484 aa9.27□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 BACH1O14867 736 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 MGRN1O60291 552 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 ITGA4P13612 1032 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 PRKCIP41743 596 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 CRY2Q49AN0 593 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 SOGA3Q5TF21 947 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 KRT79Q5XKE5 535 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 RAB34Q9BZG1 259 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 PANK4Q9NVE7 773 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 AMACRQ9UHK6 382 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 PPFIA2O75334 1257 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 NOVP48745 357 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 HYIQ5T013 277 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 ERMARDQ5T6L9 678 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 TLDC1Q6P9B6 456 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.26□□□□□ -0.93
UBQLN3-201ENST00000311659 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms