RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 PTPRSQ13332 1948 aa22.94■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 CPLX1O14810 134 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 NTRK3Q16288 839 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 CCNE2O96020 404 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 TFF2Q03403 129 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 EPC2Q52LR7 807 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 NLRP5P59047 1200 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 KRT76Q01546 638 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 PRR16Q569H4 304 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 FIBCD1Q8N539 461 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 COL1A2P08123 1366 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 ENPP3O14638 875 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 PSAPP07602 524 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 CIITAP33076 1130 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM192Q8IY95 271 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-201ENST00000311308 PPFIA3O75145 1194 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 BMP1P13497 986 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 KLRC1P26715 233 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 CD52P31358 61 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 PAK2Q13177 524 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 ODR4Q5SWX8 454 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 SAMM50Q9Y512 469 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.88■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.88■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 H3BNC9 293 aa22.88■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 DEXIO95424 95 aa22.88■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 USP11P51784 963 aa22.88■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 GPM6BQ13491 265 aa22.88■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.88■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 TRANK1O15050 2925 aa22.88■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 COL4A6Q14031 1691 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 WDR64B1ANS9 1081 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 RB1P06400 928 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 STAG3L1P0CL83 205 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 KCNQ1P51787 676 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 FAM167AQ96KS9 214 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 UIMC1Q96RL1 719 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 PADI3Q9ULW8 664 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 GINS2Q9Y248 185 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 CTNNB1P35222 781 aa22.86■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.86■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.86■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 ADAMTS3O15072 1205 aa22.85■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 CDKL5O76039 1030 aa22.85■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 GALNT17Q6IS24 598 aa22.85■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 RIT2Q99578 217 aa22.85■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.85■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.85■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 SIP14410 1827 aa22.85■■□□□ 1.25
TTC9B-201ENST00000311308 MAGEB2O15479 319 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms