RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa28.16■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 RSPH10B2B2RC85 870 aa28.15■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 CTSHP09668 335 aa28.15■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 RSPH10BP0C881 870 aa28.15■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 ATP2B1P20020 1258 aa28.15■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 GJB2P29033 226 aa28.15■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 GPNMBQ14956 572 aa28.15■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 RASIP1Q5U651 963 aa28.15■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 SMC3Q9UQE7 1217 aa28.15■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 WNT7AO00755 349 aa28.14■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 BAG4O95429 457 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 NOSTRINQ8IVI9 506 aa28.14■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 SLFN12Q8IYM2 578 aa28.14■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 VAV3Q9UKW4 847 aa28.14■■■□□ 2.1
CXCL2-201ENST00000296031 ZBBXA8MT70 800 aa28.13■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 NBNO60934 754 aa28.13■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 ACTN1P12814 892 aa28.13■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 PPP2R5CQ13362 524 aa28.13■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 UGCGQ16739 394 aa28.13■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 RPAINQ86UA6 219 aa28.13■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 KIF28PB7ZC32 967 aa28.12■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 NEMFO60524 1076 aa28.12■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 CXCL10P02778 98 aa28.12■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP28.12■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 CUL4AQ13619 759 aa28.12■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 MBTPS1Q14703 1052 aa28.12■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF484Q5JVG2 852 aa28.12■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 RSPH3Q86UC2 560 aa28.12■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 DNAJB3Q8WWF6 145 aa28.12■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 FAM167AQ96KS9 214 aa28.12■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 COL1A2P08123 1366 aa28.11■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.11■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF862O60290 1169 aa28.11■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 PRKCEQ02156 737 aa28.11■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 CALCRLQ16602 461 aa28.11■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 MTHFD1LQ6UB35 978 aa28.11■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 NRBP2Q9NSY0 501 aa28.11■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.11■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 EML1O00423 815 aa28.1■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 OATP04181 439 aa28.1■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 KLRC1P26715 233 aa28.1■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 FAM26DQ5JW98 314 aa28.1■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 SZT2Q5T011 3432 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB42B2RXF5 422 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 MCM7P33993 719 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 NCAPH2Q6IBW4 605 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 CNKSR3Q6P9H4 555 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 PCDHA12Q9UN75 941 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 EVPLQ92817 2033 aa28.09■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 SIP14410 1827 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 H3BQV1 296 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 TRAPPC10P48553 1259 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 MCTP1Q6DN14 999 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 GPR153Q6NV75 609 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 BANK1Q8NDB2 785 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 MTMR9Q96QG7 549 aa28.08■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CXCL2-201ENST00000296031 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa28.07■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 CHRNA1P02708 482 aa28.07■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 SPIRE1Q08AE8 756 aa28.07■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 GRXCR1A8MXD5 290 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 BAIAP3O94812 1187 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 TXKP42681 527 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 PSMC5P62195 406 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 EPHA7Q15375 998 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF174Q15697 407 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 TCTN1Q2MV58 587 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 XKR3Q5GH77 459 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 TTC38Q5R3I4 469 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM60Q9H2L4 133 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 CDY2AQ9Y6F7 541 aa28.06■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 C22orf31O95567 290 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 QARSP47897 775 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 MGAT3Q09327 533 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM62Q0P6H9 643 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 IER5Q5VY09 327 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 NME8Q8N427 588 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 GBF1Q92538 1859 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 OSBPL7Q9BZF2 842 aa28.05■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 M0QZ92 97 aa28.04■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 STBD1O95210 358 aa28.04■■■□□ 2.08
CXCL2-201ENST00000296031 P4HBP07237 508 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms