RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 KIF1BO60333 1816 aa22.75■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ABCA8O94911 1581 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 NEDD4P46934 1319 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 PEX19P40855 299 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 BIRC2Q13490 618 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ATG16L1Q676U5 607 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 DPP9Q86TI2 863 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 METTL23Q86XA0 190 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.74■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK13O15264 365 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 SPDL1Q96EA4 605 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 K7ERI5 159 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB5O15062 677 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 PRCPP42785 496 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 NUGGCQ68CJ6 796 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 DRC3Q9H069 523 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TJP3O95049 919 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.73■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM24O75264 130 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 CD58P19256 250 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 GDAP1Q8TB36 358 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ESYT2A0FGR8 921 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TOM1L1O75674 476 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ZBED1O96006 694 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ERICH1Q86X53 443 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 LY9Q9HBG7 655 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 SHROOM2Q13796 1616 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC53A6NM62 1247 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 C7orf31Q8N865 590 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.72■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ACSL3O95573 720 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 JAK3P52333 1124 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 RAD54LQ92698 747 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 SCOCQ9UIL1 159 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 NR3C1P04150 777 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 KRT37O76014 449 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 PLS3P13797 630 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 OSBPP22059 807 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ESRRGP62508 458 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 FAM20AQ96MK3 541 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 CAV1Q03135 178 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 NR1H3Q13133 447 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 SPARCL1Q14515 664 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TAF11Q15544 211 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 AP1ARQ63HQ0 302 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 DCLK2Q8N568 766 aa22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 PPFIA2O75334 1257 aa22.7■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 DCTN3O75935 186 aa22.7■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.7■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.7■■□□□ 1.23
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PEX3P56589 373 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 GPC5P78333 572 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ARMCX2Q7L311 632 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K7O43318 606 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB33Q86T24 672 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINI1Q99574 410 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.7■■□□□ 1.22
CCSAP-201ENST00000284617 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms