RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 MCTP2Q6DN12 878 aa27.05■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 NELFCDQ8IXH7 590 aa27.05■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 CNPY4Q8N129 248 aa27.05■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 PAGR1Q9BTK6 254 aa27.05■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 PLAAQ9Y263 795 aa27.05■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 MYH4Q9Y623 1939 aa27.04■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 hCG_1984214I3L0E3 225 aa27.04■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 ECHS1P30084 290 aa27.04■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 PI4KBQ9UBF8 816 aa27.04■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 ATAD5Q96QE3 1844 aa27.04■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 TNNI2P48788 182 aa27.04■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 ERVK-9P63128 1117 aa27.04■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 YY1AP1Q9H869 796 aa27.04■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 CAPN7Q9Y6W3 813 aa27.04■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 MDH1P40925 334 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 SEC24CP53992 1094 aa27.03■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 TNNC1P63316 161 aa27.03■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 SEPT2Q15019 361 aa27.03■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 TTBK2Q6IQ55 1244 aa27.03■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 DPEP1P16444 411 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 ZNF543Q08ER8 600 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 ASIC2Q16515 512 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 UBE2SQ16763 222 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 CEP85LQ5SZL2 805 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 KCTD10Q9H3F6 313 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 GNA14O95837 355 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 KCNA3P22001 575 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 PPP4R3AQ6IN85 833 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 OTUD6BQ8N6M0 293 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 CCDC17Q96LX7 622 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 ISCUQ9H1K1 167 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 TMBIM4Q9HC24 238 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO2-201ENST00000257818 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 KCNK3O14649 394 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 MAATS1Q7Z4T9 603 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 SCFD1Q8WVM8 642 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 CCT8L2Q96SF2 557 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 GOLPH3Q9H4A6 298 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 KIAA0754O94854 1291 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 FSBPO95073 299 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 KCTD1Q719H9 257 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 NLRP14Q86W24 1093 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 CEP89Q96ST8 783 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 PLCB1Q9NQ66 1216 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 BTNL10A8MVZ5 291 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 E9PMD0 336 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 CES2O00748 559 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 RAD17O75943 681 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 SLC16A2P36021 539 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 PTK2Q05397 1052 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 RPS6KA1Q15418 735 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 ADGRF4Q8IZF3 695 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 JMJD4Q9H9V9 463 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 MYO1FO00160 1098 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 RAD21O60216 631 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 KIF4AO95239 1232 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 HSD17B3P37058 310 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 SCFD2Q8WU76 684 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 TAF4BQ92750 862 aa27■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 H0YGN5 161 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 ACTN1P12814 892 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 HYIQ5T013 277 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 DNAAF5Q86Y56 855 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 NFS1Q9Y697 457 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 CLK2P49760 499 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 USP11P51784 963 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 KCNH2Q12809 1159 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 ADAM9Q13443 819 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 LRIG3Q6UXM1 1119 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
LMO2-201ENST00000257818 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms