RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225298.11

UTP18-201, Transcript of UTP18, small subunit processome component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UTP18, Length 1,894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18-201ENST00000225298 RBL2Q08999 1139 aa20.88■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 TC2NQ8N9U0 490 aa20.88■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.88■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 IQCDQ96DY2 449 aa20.88■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 NUP58Q9BVL2 599 aa20.88■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 CETN3O15182 167 aa20.87■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 PSAPP07602 524 aa20.87■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 MAN2A1Q16706 1144 aa20.87■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.87■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.87■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 PADI6Q6TGC4 694 aa20.87■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.87■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.87■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.87■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 PDXKO00764 312 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 RETREG2Q8NC44 543 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 ZBTB39O15060 712 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 CETPP11597 493 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 ERCC3P19447 782 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 MROH8Q9H579 483 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.86■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 UBE4BO95155 1302 aa20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 MFAP3LO75121 409 aa20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 RSPH10BP0C881 870 aa20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 KCNA2P16389 499 aa20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 CASP14P31944 242 aa20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 ICAM3P32942 547 aa20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 GTF2A2P52657 109 aa20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 ZNF131P52739 623 aa20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 ADAM9Q13443 819 aa20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 KCTD2Q14681 263 aa20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 VWA3BQ502W6 1294 aa20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 ZSCAN12O43309 604 aa20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 CNTN2Q02246 1040 aa20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 ODR4Q5SWX8 454 aa20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 NDST4Q9H3R1 872 aa20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 SFI1A8K8P3 1242 aa20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 CCNE2O96020 404 aa20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 RARRES1P49788 294 aa20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 MOGSQ13724 837 aa20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 ALCAMQ13740 583 aa20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
UTP18-201ENST00000225298 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 HIP1RO75146 1068 aa20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 CNMDO75829 334 aa20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 RGS20O76081 388 aa20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 GYPCP04921 128 aa20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 MYBP10242 640 aa20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 CCNA1P78396 465 aa20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 DRC1Q96MC2 740 aa20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 RRAGCQ9HB90 399 aa20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.83■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 NR2F2P24468 414 aa20.82■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 CASP5P51878 434 aa20.82■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 PTPN14Q15678 1187 aa20.82■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 XKR9Q5GH70 373 aa20.82■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.82■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
UTP18-201ENST00000225298 MMP19Q99542 508 aa20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.3 ms