RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051221.12

Ankrd40-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd40, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Msh3P13705 1091 aa34.31■■■■□ 3.08
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Gas2l3Q3UWW6 683 aa34.31■■■■□ 3.08
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Hook2Q7TMK6 716 aa34.31■■■■□ 3.08
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Grik4Q8BMF5 956 aa34.31■■■■□ 3.08
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 PccaQ91ZA3 724 aa34.31■■■■□ 3.08
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ank3G5E8K5 1961 aa34.3■■■■□ 3.08
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Cntnap3E9PY62 1287 aa34.3■■■■□ 3.08
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Olfr1494Q8VGP8 315 aa34.3■■■■□ 3.08
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Samd11Q1RNF8 542 aa34.29■■■■□ 3.08
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Kmt5aQ2YDW7 349 aa34.29■■■■□ 3.08
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Col5a3Q9JLI2 1739 aa34.29■■■■□ 3.08
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 LctF8VPT3 1931 aa34.29■■■■□ 3.08
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Apol7aB2RT54 418 aa34.28■■■■□ 3.08
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Zmynd15Q8C0R7 736 aa34.28■■■■□ 3.08
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Olfr397Q8VEZ6 315 aa34.27■■■■□ 3.08
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Acad12D3Z7X0 555 aa34.27■■■■□ 3.08
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Q8C5S3 137 aa34.27■■■■□ 3.08
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Fbxo16Q9QZM9 334 aa34.27■■■■□ 3.08
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ccr1P51675 355 aa34.26■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Tarbp2P97473 365 aa34.26■■■■□ 3.07
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Atp8b5A3FIN4 1183 aa34.24■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 MtrA6H5Y3 1253 aa34.24■■■■□ 3.07
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Hoxc8P09025 242 aa34.24■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Palb2Q3U0P1 1104 aa34.24■■■■□ 3.07
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Atp2b1G5E829 1220 aa34.22■■■■□ 3.07
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Trap1aP19473 224 aa34.21■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 MaeaQ4VC33 396 aa34.21■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 E2f8Q58FA4 860 aa34.21■■■■□ 3.07
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 C6.1alQ7M757 291 aa34.21■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 VcpkmtQ8C436 228 aa34.21■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Dmtf1Q8CE22 761 aa34.21■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Alas1Q8VC19 642 aa34.21■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Med4Q9CQA5 270 aa34.21■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Emc2Q9CRD2 297 aa34.21■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Htra3Q9D236 459 aa34.21■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Galk1Q9R0N0 392 aa34.21■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Mx2Q9WVP9 655 aa34.21■■■■□ 3.07
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Arid3bQ9Z1N7 568 aa34.21■■■■□ 3.07
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Tspan8Q8R3G9 235 aa34.2■■■■□ 3.07
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa34.2■■■■□ 3.06
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Cd68P31996 326 aa34.19■■■■□ 3.06
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Hoxb13P70321 286 aa34.19■■■■□ 3.06
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Zbtb9Q8CDC7 459 aa34.19■■■■□ 3.06
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