RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nkiras1Q8CEC5 192 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vps36Q91XD6 386 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mfap3Q922T2 349 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Xrcc4Q924T3 326 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sntg2Q925E0 539 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fgfr1op2Q9CRA9 253 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ankle1A8VU90 534 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm5934D3Z4U6 212 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Eps15P42567 897 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Iqsec3Q3TES0 1195 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Trim54Q9ERP3 366 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ndufa13Q9ERS2 144 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Angptl2Q9R045 493 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cetn2Q9R1K9 172 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa9.97□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pde4bB1AWC9 736 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm5862K7N5V5 267 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pgk2P09041 417 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 GnaqP21279 359 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pdcd2P46718 343 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Naa20P61600 178 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp781Q0P5U5 243 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ctdnep1Q3TP92 244 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Efr3bQ6ZQ18 817 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zbed3Q9D0L1 228 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 1700123K08RikQ9D991 295 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nrxn1Q9CS84 1514 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 TnksQ6PFX9 1320 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Arhgap33Q80YF9 1305 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lonrf2B2RT44 518 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Trim15G3UY57 292 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fam8a1Q3URQ4 399 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Adrbk2Q3UYH7 688 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kif22Q3V300 660 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vps54Q5SPW0 977 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gstt1Q64471 240 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prpf38bQ80SY5 542 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gramd1bQ80TI0 738 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cep85Q8BMK0 761 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Usp44Q8C2S0 711 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Catsper1Q91ZR5 686 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dph5Q9CWQ0 281 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dctn3Q9Z0Y1 186 aa9.96□□□□□ -0.81
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pfkfb3A7UAK5 555 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kif23E9Q5G3 953 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Speer4dL7N216 212 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Coq7P97478 217 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Stx2Q00262 289 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ssrp1Q08943 708 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ceacam5Q3UKK2 947 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ckap2Q3V1H1 664 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm5935Q497S0 212 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 WhammQ571B6 793 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lrrc8bQ5DU41 803 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 ItgaeQ60677 1167 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mcm7Q61881 719 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Birc2Q62210 612 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Arhgef18Q6P9R4 1021 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ints8Q80V86 995 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Trnau1apQ80VC6 287 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 ChiaQ91XA9 473 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Krt27Q9Z320 448 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 XlrP05531 208 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Klra6Q60653 266 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Znf148Q61624 794 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prm3Q62100 101 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lilrb4Q64281 335 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cep70Q6IQY5 616 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ubap1Q8BH48 502 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Golim4Q8BXA1 655 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lrrc41Q8K1C9 807 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 St7Q99M96 577 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fam227aQ9D3V8 625 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 LrgukQ9D5S7 820 aa9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Orc3Q9JK30 715 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CtcflA2APF3 636 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prr16A3KMN5 304 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lrrc10bG3XA50 292 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prl7a2O54831 253 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 NapbP28663 298 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vps33bP59016 617 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sema4aQ62178 760 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q8C6G1 249 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gbp5Q8CFB4 590 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fam192aQ91WE2 254 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pcdhb3Q91XZ7 784 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Casq2O09161 415 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tpp1O89023 562 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Krt13P08730 437 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RaraP11416 462 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vav1P27870 845 aa9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ugt1a2P70691 533 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.5 ms