RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa20.12■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm3414Q3TNU4 584 aa20.12■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Msantd2Q6NZR2 559 aa20.12■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa20.12■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Osbpl2Q8BX94 484 aa20.12■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccz1Q8C1Y8 480 aa20.12■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PdgfcQ8CI19 345 aa20.12■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem134Q8R0J4 195 aa20.12■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Syce1Q9D495 329 aa20.12■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ifi35Q9D8C4 286 aa20.12■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hic1Q9R1Y5 733 aa20.12■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ace3D0G895 737 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cd68P31996 326 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 MafbP54841 323 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Anks1aP59672 1150 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Etv6P97360 485 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdc14aQ6GQT0 603 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Jade2Q6ZQF7 829 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lrrc41Q8K1C9 807 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Txndc5Q91W90 417 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Syt5Q9R0N5 386 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tex21Q9R0U9 575 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sucla2Q9Z2I9 463 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lrrc38A2VDH3 298 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm4907B1AXB9 411 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 GmnnO88513 206 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Samsn1P57725 372 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 E2f8Q58FA4 860 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cfap52Q5F201 620 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdc37Q61081 379 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ddr2Q62371 854 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ece2Q80Z60 881 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Spata32Q8C5V0 334 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hdhd5Q91WM2 419 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adgrf4Q9D2L6 698 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa20.11■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cops5O35864 334 aa20.1■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cd70O55237 195 aa20.1■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 GpiP06745 558 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lta4hP24527 611 aa20.1■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hook2Q7TMK6 716 aa20.1■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa20.1■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Limd1Q9QXD8 668 aa20.1■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mt-CybP00158 381 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hoxc6P10629 235 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lrrc55Q3UY51 311 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem63cQ8CBX0 802 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atp2a1Q8R429 994 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abhd2Q9QXM0 425 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Magea10A2AMW4 325 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ugt1a6bK9J7B2 531 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pgk2P09041 417 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyp11b2P15539 500 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tpm2P58774 284 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ugt1a6Q64435 531 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kiaa0391Q8JZY4 584 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Enox2Q8R0Z2 598 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ribc1Q9D0B8 379 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 MsraQ9D6Y7 233 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arhgef7Q9ES28 862 aa20.09■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Usp34Q6ZQ93 3582 aa20.08■□□□□ 0.81
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm45208A0A140LJ36 292 aa20.08■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dnajc25A2ALW5 357 aa20.08■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ttll6A4Q9E8 822 aa20.08■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Jakmip2D3YXK0 820 aa20.08■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm5934D3Z4U6 212 aa20.08■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Specc1lQ2KN98 1118 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam214aQ69ZK7 1075 aa20.08■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mical1Q8VDP3 1048 aa20.08■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa20.08■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Eif4e3Q9DBB5 207 aa20.08■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Itga2bQ9QUM0 1033 aa20.08■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Chaf1aQ9QWF0 911 aa20.08■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 RptorQ8K4Q0 1335 aa20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r78K7N6U5 853 aa20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Axin2O88566 840 aa20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Acsl1P41216 699 aa20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Akr1b1P45376 316 aa20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tarbp2P97473 365 aa20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 MaeaQ4VC33 396 aa20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Arhgap1Q5FWK3 439 aa20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppp1r1bQ60829 194 aa20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tsg101Q61187 391 aa20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Micall1Q8BGT6 870 aa20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Drd5Q8BLD9 478 aa20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rpn1Q91YQ5 608 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Q9D5Q8 446 aa20.07■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Exoc4O35382 975 aa20.06■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myo1aO88329 1043 aa20.06■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 P4hbP09103 509 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ptgs1P22437 602 aa20.06■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kcnd1Q03719 651 aa20.06■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kcnma1Q08460 1209 aa20.06■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam189a2Q4FZH1 290 aa20.06■□□□□ 0.8
Cbx1-201ENSMUST00000018810 March6Q6ZQ89 909 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.8 ms