RNA–Protein interactions for RNA: YOR229W

WTM2, Transcript of Transcriptional modulator, yeast

Gene WTM2, Length 1,404 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WTM2	YOR229W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
WTM2	YOR229W	COS2	P0CX12	379 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	COS3	P0CX13	379 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YCL068C	P25593	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	NDI1	P32340	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YKR075C	P36155	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	DTR1	P38125	572 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RIB5	P38145	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ECM8	P38246	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	UBA4	P38820	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SPC97	P38863	823 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ECM10	P39987	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	VRG4	P40107	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SDP1	P40479	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	HIT1	P46973	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YJR149W	P47177	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YGR066C	P53242	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	COS6	P53344	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	PPN1	Q04119	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	FAR8	Q05040	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ADY4	Q05955	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	NRT1	Q08485	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	GPM2	Q12008	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SFM1	Q12314	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	EMP46	Q12396	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YPT6	Q99260	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
WTM2	YOR229W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	AMD2	P22580	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	DOA1	P36037	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	PPS1	P38148	807 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	TSC10	P38342	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	MLH1	P38920	769 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SEO1	P39709	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	DDI1	P40087	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YGR201C	P42936	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	BIO3	P50277	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YGL114W	P53134	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	IMO32	P53219	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	TAM41	P53230	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ARL3	Q02804	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	VTA1	Q06263	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	BSC6	Q08280	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SFG1	Q12507	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	PET20	Q99373	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	CBS2	P14905	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	PRR1	P28708	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	MAL33	P38157	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SLM4	P38247	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YBP1	P38315	674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	FET3	P38993	636 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RMD6	P39975	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YER121W	P40076	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	PRM10	P42946	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	GSM1	P42950	618 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	NMD5	P46970	1048 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RTT102	P53330	157 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	MPS1	P54199	764 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ERG5	P54781	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	NHP10	Q03435	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	FAR10	Q06001	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	TMA16	Q08687	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	TRM11	Q12463	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	PRC1	P00729	532 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ALG7	P07286	448 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	REV1	P12689	985 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	CKI1	P20485	582 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YCR061W	P25639	631 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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