RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W CUP9P41817 306 aa2.04□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ERG26P53199 349 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W PRO2P54885 456 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YML131WQ03102 365 aa2.04□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YPR078CQ06813 372 aa2.04□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W COX17Q12287 69 aa2.04□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W BLM10P43583 2143 aa2.04□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W CHA1P25379 360 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W PMT2P31382 759 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W TOA1P32773 286 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YBR139WP38109 508 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W IFA38P38286 347 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W TDA11P38854 504 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YDR089WP38966 869 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W VRG4P40107 337 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W IME4P41833 600 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W RPN14P53196 417 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W LSC1P53598 329 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ERV41Q04651 352 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YDR278CQ05612 105 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W GRS2Q06817 618 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ENT4Q07872 247 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W AAD15Q08361 143 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ATX2Q12067 313 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YPR022CQ12139 1133 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W RMD5Q12508 421 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W AMD1P15274 810 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W GID7P25569 745 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W GSH1P32477 678 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W SLC1P33333 303 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W NUP120P35729 1037 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W TEF4P36008 412 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ADE17P38009 592 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W PCH2P38126 564 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W FLC2P39719 783 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W TPA1P40032 644 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ALG8P40351 577 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W MDV1P47025 714 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W NRT1Q08485 598 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W SRL1Q08673 210 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YOR376WQ08900 122 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W RCN2Q12044 265 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W BAG7Q12128 409 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W GTT2Q12390 233 aa2.03□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ATP2P00830 511 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RAD10P06838 210 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ILV2P07342 687 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W PET111P08468 800 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ATP11P32453 318 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SRB5P32585 307 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W CNS1P33313 385 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.02□□□□□ -2.09not detected
SSQ1YLR369W PHM8P40025 321 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W LYS20P48570 428 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YPR003CP53394 754 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W OSH6Q02201 448 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W GTB1Q04924 702 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W IVY1Q04934 453 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W VAM6Q07468 1049 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RSA1Q08932 381 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MDM32Q12171 622 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YOR114WQ12219 294 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W UBX3Q12229 455 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YRM1Q12340 786 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YOR012WQ12351 137 aa2.02□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SEM1O94742 89 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TY2A-FP0CX61 438 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TY2A-GR2P0CX62 438 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SPS100P13130 326 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W GUK1P15454 187 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W CNA1P23287 553 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TY2A-CP25383 438 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W LAC1P28496 418 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MTR2P34232 184 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MUD2P36084 527 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W STB6P36085 766 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W ARN1P38731 627 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YHR045WP38775 560 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data2.01□□□□□ -2.09not detected
SSQ1YLR369W BNA1P47096 177 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SUB1P54000 292 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YSA1Q01976 231 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TY2A-DR2Q03483 438 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W VTA1Q06263 330 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W YLR352WQ06479 807 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TMA16Q08687 178 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TY2A-BQ12260 438 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TY2A-OR2Q12293 438 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TY2A-DR1Q12392 438 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TY2A-OR1Q12439 438 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W TY2A-DR3Q99303 438 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W MET8P15807 274 aa2.01□□□□□ -2.09
SSQ1YLR369W SLY1P22213 666 aa2.01□□□□□ -2.09
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