RNA–Protein interactions for RNA: YKR065C

PAM17, Transcript of Constituent of the TIM23 complex, yeast

Gene PAM17, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM17	YKR065C	YDR056C	Q12025	205 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	SRN2	Q99176	213 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	CDC21	P06785	304 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	SEC12	P11655	471 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	PPH21	P23594	369 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.97	□□□□□ -1.29	not detected
PAM17	YKR065C	NUP120	P35729	1037 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	BMT2	P38278	337 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	ARN1	P38731	627 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	YJL043W	P47053	257 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	COS12	P53053	380 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	IRC15	Q02733	499 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	RRN11	Q04712	507 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	ENT4	Q07872	247 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	APC9	Q12107	265 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	RGT2	Q12300	763 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PAM17	YKR065C	FMP27	Q06179	2628 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	SPS22	P25380	463 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	CWH43	P25618	953 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	DAL3	P32459	195 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	YEN1	P40028	759 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	ZIM17	P42844	174 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	IRC5	P43610	853 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	NAS6	P50086	228 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	FMN1	Q03778	218 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	BNA5	Q05979	453 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	YLR049C	Q12110	428 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	AAC1	P04710	309 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	SDH3	P33421	198 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	YCR087C-A	P37263	153 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	YBR071W	P38243	211 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	INM1	P38710	295 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	ERV46	P39727	415 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	MRX1	P40050	688 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	RIF2	Q06208	395 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	YPR011C	Q12251	326 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	PST1	Q12355	444 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	SAS5	Q99314	248 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	COS2	P0CX12	379 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	COS3	P0CX13	379 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	HES1	P35843	434 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	YDR089W	P38966	869 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	MNT3	P40549	630 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	COS4	P43542	379 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	GOR1	P53839	350 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	RPM2	Q02773	1202 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	GAS3	Q03655	524 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	ECM11	Q04110	302 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	SPC24	Q04477	213 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	YML096W	Q04489	525 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	RAD34	Q06665	692 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	YLR413W	Q06689	675 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	DIN7	Q12086	430 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	NMD4	Q12129	218 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	FRE7	Q12333	620 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	LAG2	Q92325	660 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	PHO91	P27514	894 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	SFC1	P33303	322 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	FRE2	P36033	711 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	ARA1	P38115	344 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	GGC1	P38988	300 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	MET18	P40469	1032 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	IAH1	P41734	238 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	NIT2	P47016	307 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	TIS11	P47977	285 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	GTO1	P48239	356 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	YNL140C	P53910	189 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	GTB1	Q04924	702 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	GET4	Q12125	312 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	YMR085W	P0CF18	432 aa		6.92	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	BUB3	P26449	341 aa		6.92	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	SSH4	P32343	579 aa		6.92	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	CAF4	P36130	643 aa		6.92	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	SOL2	P37262	315 aa		6.92	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	MAD2	P40958	196 aa		6.92	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
PAM17	YKR065C	SNO3	P43544	222 aa		6.92	□□□□□ -1.3

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