RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	MCA1	Q08601	432 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	FDH1	Q08911	376 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	RSA1	Q08932	381 aa		10.49	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	RPB5	P20434	215 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	POL4	P25615	582 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	PET112	P33893	541 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	MPM1	P40364	252 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	YGR201C	P42936	225 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	TRM9	P49957	279 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	RSC9	Q03124	581 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	KRE28	Q04431	385 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	SWA2	Q06677	668 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	LOT6	Q07923	191 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	DCI1	Q08558	271 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	SFM1	Q12314	213 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	YCR006C	P25350	157 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	MSN2	P33748	704 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	NUF2	P33895	451 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	TUL1	P36096	758 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	BIG1	P38813	335 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	FAA3	P39002	694 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	FMP52	P40008	231 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	GPI8	P49018	411 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	PIN2	Q12057	282 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	YDR061W	Q12298	539 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	YIM1	P28625	365 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	MRPL15	P36523	253 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	YFL066C	P43538	392 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	TIM54	P47045	478 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	RIM13	Q03792	727 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	REH1	Q06709	432 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	YEH1	Q07804	573 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	BSC1	Q12140	328 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RNQ1	YCL028W	CDC4	P07834	779 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	TAF14	P35189	244 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	YIL086C	P40503	102 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	FAR7	P43592	221 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	TWF1	P53250	332 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	TSC13	Q99190	310 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	GAL4	P04386	881 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	PBS2	P08018	668 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	LOT5	P34234	306 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	YRB2	P40517	327 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	YGR012W	P53206	393 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	SEC39	Q12745	709 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	APN1	P22936	367 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	MXR2	P25566	168 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	PTP2	P29461	750 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	GSH1	P32477	678 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	HCS1	P34243	683 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	PRE3	P38624	215 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	YAR028W	P39548	234 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	YPL107W	Q02873	248 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	RAD30	Q04049	632 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	GUP2	Q08929	609 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	MRX4	Q12467	430 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	FAR1	P21268	830 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	PTR2	P32901	601 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	MRPL6	P32904	214 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	VPS51	P36116	164 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	RPS27B	P38711	82 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	OCA5	P38738	679 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	TRR2	P38816	342 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	MTG2	P38860	518 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	GIP2	P40036	548 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	SPG5	P42933	373 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	RSF1	Q05043	376 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	ENT2	Q05785	613 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	ARO10	Q06408	635 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	GLE1	Q12315	538 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	AAC3	P18238	307 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	CTR86	P25355	563 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	SPC42	P36094	363 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	BET3	P36149	193 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	MET28	P40573	187 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	AAD10	P47182	288 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	ROM1	P53046	1155 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	YGR266W	P53326	701 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNQ1	YCL028W	MTQ1	P53944	314 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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