RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641182.1

TRIM16L-215, Transcript of tripartite motif containing 16 like, human

Gene TRIM16L, Length 1,176 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM16L-215	ENST00000641182	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182		Q9Y3F1	56 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	SAMM50	Q9Y512	469 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	CENPF	P49454	3210 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182		A6NJR5	290 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	ZNF862	O60290	1169 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	ADAMTS4	O75173	837 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	LGR5	O75473	907 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	PSAP	P07602	524 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	PLCG1	P19174	1290 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	GJA9	P57773	515 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	PSMC6	P62333	389 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	NKX3-2	P78367	333 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	BEX3	Q00994	111 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	LONRF3	Q496Y0	759 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	LHX8	Q68G74	356 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	TRIM50	Q86XT4	487 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	ERMN	Q8TAM6	284 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	LXN	Q9BS40	222 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	ARID2	Q68CP9	1835 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	EMSY	Q7Z589	1322 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	TMEM150B	A6NC51	233 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182		E9PMD0	336 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	ZBTB39	O15060	712 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	PGK1	P00558	417 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	LGALS2	P05162	132 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	RARB	P10826	455 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	TXLNA	P40222	546 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	SYK	P43405	635 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	TPH2	Q8IWU9	490 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	DHX58	Q96C10	678 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	MTR	Q99707	1265 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	ZNF302	Q9NR11	478 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	STK24	Q9Y6E0	443 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	BACH1	O14867	736 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	SLC26A4	O43511	780 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	ZNF202	O95125	648 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	LYPLA2	O95372	231 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	ZNF286B	P0CG31	522 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	CCL5	P13501	91 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	PSMC5	P62195	406 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	ARMC5	Q96C12	935 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	CALML4	Q96GE6	196 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	ZNF333	Q96JL9	665 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TRIM16L-215	ENST00000641182	PPFIA4	O75335	1185 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TRIM16L-215	ENST00000641182	MBD3	O95983	291 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TRIM16L-215	ENST00000641182	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TRIM16L-215	ENST00000641182	MUT	P22033	750 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TRIM16L-215	ENST00000641182	STAT6	P42226	847 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TRIM16L-215	ENST00000641182	CPT1A	P50416	773 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TRIM16L-215	ENST00000641182	STAT5B	P51692	787 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TRIM16L-215	ENST00000641182	PRKCE	Q02156	737 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TRIM16L-215	ENST00000641182	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TRIM16L-215	ENST00000641182	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		11.39	□□□□□ -0.59

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