RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 DGKIO75912 1065 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 CD52P31358 61 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 GATMP50440 423 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 PPFIA1Q13136 1202 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 GRIK4Q16099 956 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 SPPL3Q8TCT6 385 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 PKD2L1Q9P0L9 805 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 CLEC1BQ9P126 229 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 PLEKHA8P1O95397 391 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 ITGB1P05556 798 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 IGBP1P78318 339 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 IER5LQ5T953 404 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 SEPT1Q8WYJ6 367 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 MSLNLQ96KJ4 702 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 LMAN2LQ9H0V9 348 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-228ENST00000599236 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 STXBP3O00186 592 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 PIK3CDO00329 1044 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 NCK2O43639 380 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 MMP1P03956 469 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 TMEM62Q0P6H9 643 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 TRDNQ13061 729 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 TRAF1Q13077 416 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 UBE2SQ16763 222 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 LY9Q9HBG7 655 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 TUBE1Q9UJT0 475 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 FAM50BQ9Y247 325 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 SPTBN4Q9H254 2564 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 INSRRP14616 1297 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 RXRAP19793 462 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 CHMLP26374 656 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 RBM10P98175 930 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 TAF2Q6P1X5 1199 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 CATIPQ7Z7H3 387 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 NLRX1Q86UT6 975 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 KLHL23Q8NBE8 558 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 TMX1Q9H3N1 280 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 CD207Q9UJ71 328 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 ERICH2A1L162 156 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 EYA4O95677 639 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 GLP2RO95838 553 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 TTC22Q5TAA0 569 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 XRRA1Q6P2D8 792 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF654Q8IZM8 581 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 PRSS33Q8NF86 280 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 NCOA7Q8NI08 942 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 EDAQ92838 391 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 GLG1Q92896 1179 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 GPRASP2Q96D09 838 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 CDHR5Q9HBB8 845 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 ERAP1Q9NZ08 941 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 PADI3Q9ULW8 664 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 MYO10Q9HD67 2058 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 PPFIA3O75145 1194 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 TMEM266Q2M3C6 531 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 POF1BQ8WVV4 589 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 CUL5Q93034 780 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 PLVAPQ9BX97 442 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 PSTPIP2Q9H939 334 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 HCSTQ9UBK5 93 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 RWDD3Q9Y3V2 267 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 EVPLQ92817 2033 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 LOC730098B7Z3J9 87 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 PER2O15055 1255 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 MGEA5O60502 916 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 NRIP1P48552 1158 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 NDUFV1P49821 464 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 RSPH3Q86UC2 560 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 CCDC82Q8N4S0 544 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-228ENST00000599236 P2RX5Q93086 422 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms