RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 TAPT1Q6NXT6 567 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CPXCR1Q8N123 301 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 FAM133AQ8N9E0 248 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CUL5Q93034 780 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 ACAD9Q9H845 621 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 VAT1LQ9HCJ6 419 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 INSL6Q9Y581 213 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.94□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 ZEB2O60315 1214 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 DEXIO95424 95 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 RXRAP19793 462 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 RBL2Q08999 1139 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 STK3Q13188 491 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 ADAM15Q13444 863 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 GPM6BQ13491 265 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM29Q14134 588 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PTPN21Q16825 1174 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 HOMER1Q86YM7 354 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 BICD2Q8TD16 824 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 GTF3C6Q969F1 213 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 DDX11Q96FC9 970 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 SAMD11Q96NU1 681 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 KIF2CQ99661 725 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 SENP2Q9HC62 589 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CLEC1BQ9P126 229 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 STK36Q9NRP7 1315 aa8.93□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 ALAS1P13196 640 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 SLC4A3P48751 1232 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CNTN2Q02246 1040 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 COASYQ13057 564 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 BFSP2Q13515 415 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM192Q8IY95 271 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 RETREG2Q8NC44 543 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 RGS22Q8NE09 1264 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 SNX21Q969T3 373 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 MTMR8Q96EF0 704 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 RNF146Q9NTX7 359 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 MYH7BA7E2Y1 1941 aa8.92□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 C5orf67F2Z3F1 127 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 ABCB7O75027 752 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 LGR5O75473 907 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 ARP10275 920 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 SCG2P13521 617 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CALML3P27482 149 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 GNA11P29992 359 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 NAPAP54920 295 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 SCRN1Q12765 414 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CAMK1Q14012 370 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 MBTPS1Q14703 1052 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms