RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592373.1

MED16-208, Transcript of mediator complex subunit 16, humanhuman

TSL 3

Gene MED16, Length 927 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16-208ENST00000592373 CALCRLQ16602 461 aa20.49■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.49■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 MCTP1Q6DN14 999 aa20.49■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.49■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 POTEDQ86YR6 584 aa20.49■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 UIMC1Q96RL1 719 aa20.49■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 GDF15Q99988 308 aa20.49■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.49■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 CEP290O15078 2479 aa20.49■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 PITPNM1O00562 1244 aa20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 ADAM17P78536 824 aa20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 RBL2Q08999 1139 aa20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 PTK7Q13308 1070 aa20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 BFSP2Q13515 415 aa20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 MFSD5Q6N075 450 aa20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 CAGE1Q8TC20 777 aa20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 MTMR9Q96QG7 549 aa20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 HIPK3Q9H422 1215 aa20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 LTBP2Q14767 1821 aa20.48■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 HBP1O60381 514 aa20.47■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 MCM7P33993 719 aa20.47■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 PLCB4Q15147 1175 aa20.47■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 TTC38Q5R3I4 469 aa20.47■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.47■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.47■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 BRAPQ7Z569 592 aa20.47■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.47■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.47■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 VAV3Q9UKW4 847 aa20.47■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 POTEB3A0JP26 581 aa20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 WNT7AO00755 349 aa20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 ATP2B1P20020 1258 aa20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 SYT1P21579 422 aa20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 PPFIA1Q13136 1202 aa20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 POTEBQ6S5H4 581 aa20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 SERINC5Q86VE9 423 aa20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 TMEM199Q8N511 208 aa20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 GJA10Q969M2 543 aa20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 FAM167AQ96KS9 214 aa20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 SETD4Q9NVD3 440 aa20.46■□□□□ 0.87
MED16-208ENST00000592373 LAD1O00515 517 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 CYP2C9P11712 490 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 INSRRP14616 1297 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 ITGB8P26012 769 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 MARK3P27448 753 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 ZNF174Q15697 407 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 GRIK4Q16099 956 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 RETREG2Q8NC44 543 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 BADQ92934 168 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 PRO3102Q9H379 93 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 TRPC6Q9Y210 931 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 COL1A2P08123 1366 aa20.45■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 A0A1W2PPC1 479 aa20.44■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 CHMP2AO43633 222 aa20.44■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 CAND2O75155 1236 aa20.44■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 HIC1Q14526 733 aa20.44■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 EPHA7Q15375 998 aa20.44■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.44■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.44■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.44■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.44■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 TREHO43280 583 aa20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 OR52Z1P0C646 297 aa20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 ATP4AP20648 1035 aa20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 TXKP42681 527 aa20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 PSMC5P62195 406 aa20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 FPGSQ05932 587 aa20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.867e-8■■■□□ 17
MED16-208ENST00000592373 RPAINQ86UA6 219 aa20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.43■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 EML1O00423 815 aa20.42■□□□□ 0.86
MED16-208ENST00000592373 STX6O43752 255 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms