RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMC5P62195 406 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 NEDD9Q14511 834 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CST9Q5W186 159 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 OTUD6AQ7L8S5 288 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 DYMQ7RTS9 669 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ADSSL1Q8N142 457 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 NELFBQ8WX92 580 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ABHD8Q96I13 439 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 LXNQ9BS40 222 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 EDNRBP24530 442 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC12A3P55017 1021 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP2C8P10632 490 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP11B2P19099 503 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 NCAPHQ15003 741 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ECM1Q16610 540 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNK18Q7Z418 384 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 BHMT2Q9H2M3 363 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RGL1Q9NZL6 768 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 PRCPP42785 496 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CNTN2Q02246 1040 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 GRM1Q13255 1194 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM26FQ5R3K3 315 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 C4orf19Q8IY42 314 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 FANCLQ9NW38 375 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-212ENST00000591041 CCNE1P24864 410 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 FANCCQ00597 558 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 GDAQ9Y2T3 454 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 NRDCO43847 1150 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM13AO94988 1023 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNA2P16389 499 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 UBASH3AP57075 661 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC63Q05C16 580 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 COASYQ13057 564 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 Q3C1V9 767 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC15Q8TF66 581 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 P2RX5Q93086 422 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC19Q96DA6 116 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM47Q96LD4 638 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNG1Q9UIX4 513 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 SOWAHBA6NEL2 793 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC10A3P09131 477 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 THAP9Q9H5L6 903 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 FRMD3A2A2Y4 597 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 CD44P16070 742 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 GUCY2CP25092 1073 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHH3Q7Z736 793 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 BANK1Q8NDB2 785 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 GSDMDP57764 484 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 ALCAMQ13740 583 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 GIT2Q14161 759 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 RINT1Q6NUQ1 792 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 MORC4Q8TE76 937 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 CAPNS2Q96L46 248 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNKQ9P0W0 207 aa25.09■■□□□ 1.61
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