RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF577Q9BSK1 485 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 TRPC6Q9Y210 931 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 NRCAMQ92823 1304 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 NID2Q14112 1375 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0C4DFX4 3053 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 KAT6AQ92794 2004 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 ADAMTS3O15072 1205 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 BAIAP3O94812 1187 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 CYP3A4P08684 503 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 FOSL2P15408 326 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 STAT5BP51692 787 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 NEK4P51957 841 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 AK2P54819 239 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 RBL2Q08999 1139 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 SCRN1Q12765 414 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 IKBKEQ14164 716 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 GRIN2CQ14957 1233 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 NIPA1Q7RTP0 329 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 RSPH3Q86UC2 560 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 MYLIPQ8WY64 445 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 SLC9A7Q96T83 725 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 NFASCO94856 1347 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 TRANK1O15050 2925 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 REV3LO60673 3130 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 RRN3P2A6NIE6 340 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 PFKFB2O60825 505 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 NBNO60934 754 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 DTNBO60941 627 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 LGR5O75473 907 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 SEC24BO95487 1268 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 INSRRP14616 1297 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 MYOGP15173 224 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 USP11P51784 963 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 GRIK4Q16099 956 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 BLIDQ8IZY5 108 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 TBCKQ8TEA7 893 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 AIFM3Q96NN9 605 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 TBC1D22BQ9NU19 505 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 METRNQ9UJH8 293 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 TUBE1Q9UJT0 475 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 SAMM50Q9Y512 469 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 EMSYQ7Z589 1322 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 WDR81Q562E7 1941 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 MYO9BQ13459 2157 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 POTEB3A0JP26 581 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 TLL1O43897 1013 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 EFCAB14O75071 495 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 CAND2O75155 1236 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 CXCL10P02778 98 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 IGFBP4P22692 258 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 HOXC8P31273 242 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 CIITAP33076 1130 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 SLC26A2P50443 739 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 GPNMBQ14956 572 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 GALNT17Q6IS24 598 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 POTEBQ6S5H4 581 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 NECAB1Q8N987 351 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 WASF1Q92558 559 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 SEPT8Q92599 483 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 PCYT2Q99447 389 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRM-214ENST00000583153 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms