RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-205ENST00000563559 OPA1O60313 960 aa20.23■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 PALMO75781 387 aa20.23■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 CLSTN1O94985 981 aa20.23■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 ANXA13P27216 316 aa20.23■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 SREBF1P36956 1147 aa20.23■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 ICA1Q05084 483 aa20.23■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.23■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.23■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 FBXO11Q86XK2 927 aa20.23■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.23■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.23■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.23■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.22■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.22■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 ZBTB9Q96C00 473 aa20.22■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.22■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 A0A087X0T9 212 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 FAM228BP0C875 321 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 CIITAP33076 1130 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 PDE6BP35913 854 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 MMP14P50281 582 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 F5H6K3 240 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 CES2O00748 559 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 KLRC1P26715 233 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 KLRC3Q07444 240 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 PPFIA1Q13136 1202 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 SPAG5Q96R06 1193 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 REEP2Q9BRK0 252 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
RRN3-205ENST00000563559 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 SLC7A5Q01650 507 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 ARID5AQ03989 594 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 TCP10Q12799 353 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 LENG9Q96B70 501 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 UIMC1Q96RL1 719 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 ATP8B3O60423 1300 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 TRAF1Q13077 416 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 SFR1Q86XK3 245 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 RUFY1Q96T51 708 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 SH3GL2Q99962 352 aa20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 UCHL3P15374 230 aa20.19■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 GBP6Q6ZN66 633 aa20.19■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.19■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 MASTLQ96GX5 879 aa20.19■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.19■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 AFF2P51816 1311 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 HSF2BPO75031 334 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 CYP3A4P08684 503 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 GAP43P17677 238 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 CASP5P51878 434 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 PSMC6P62333 389 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 LRRC31Q6UY01 552 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 TAF4BQ92750 862 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 MS4A14Q96JA4 679 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 GDF3Q9NR23 364 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 EHD2Q9NZN4 543 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 SIPA1L1O43166 1804 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 FAM86B1E9PN63 330 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 PRKCIP41743 596 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 PAK2Q13177 524 aa20.18■□□□□ 0.82
RRN3-205ENST00000563559 VPS36Q86VN1 386 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms