RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 DYTNA2CJ06 578 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 FKTNO75072 461 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 BBOX1O75936 387 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 NAT1P18440 290 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 GNALP38405 381 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 CASP2P42575 452 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 TRAPPC10P48553 1259 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 WASHC5Q12768 1159 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 CRHR2Q13324 411 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ECM1Q16610 540 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 TEX19Q8NA77 164 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 GCC1Q96CN9 775 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 OSMRQ99650 979 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 BACH2Q9BYV9 841 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 CAPN10Q9HC96 672 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 A0A0C4DFX4 3053 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 VCANP13611 3396 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 VGLL3A8MV65 326 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 SNAP23O00161 211 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 WNT10BO00744 389 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 TBX3O15119 743 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 CAND2O75155 1236 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 VAMP4O75379 141 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 TSPAN15O95858 294 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 IGHDP01880 384 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 TCIRG1Q13488 830 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 FRS2Q8WU20 508 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 APBA2Q99767 749 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 VPS33BQ9H267 617 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 STIM2Q9P246 746 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 POLG2Q9UHN1 485 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 JAG2Q9Y219 1238 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 MGAMO43451 1857 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 CLRN2A0PK11 232 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ENPP3O14638 875 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 KIF5CO60282 957 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 TPM2P07951 284 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 RBP3P10745 1247 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 RRM1P23921 792 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 RBL2Q08999 1139 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 IFT88Q13099 833 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 OCLNQ16625 522 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 LONRF1Q17RB8 773 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 DACT2Q5SW24 774 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 CERS5Q8N5B7 392 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 NETO1Q8TDF5 533 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ERP27Q96DN0 273 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 SLC39A13Q96H72 371 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 WNK4Q96J92 1243 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 CDHR1Q96JP9 859 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 PTPN18Q99952 460 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 FANCIQ9NVI1 1328 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 CTGFP29279 349 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 ASPAP45381 313 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-209ENST00000561136 TM4SF4P48230 202 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms