RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	EFHB	Q8N7U6	833 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	NEK1	Q96PY6	1258 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	PXMP2	Q9NR77	195 aa		15.95	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	OPLAH	O14841	1288 aa		15.94	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	HOXC8	P31273	242 aa		15.94	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	PKN1	Q16512	942 aa		15.94	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	PTPN21	Q16825	1174 aa		15.94	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	POF1B	Q8WVV4	589 aa		15.94	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		15.94	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		15.94	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		15.94	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	HCST	Q9UBK5	93 aa		15.94	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222		B4DLN1	442 aa		15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222		H3BRB1	525 aa		15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	PPFIA4	O75335	1185 aa		15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	CFB	P00751	764 aa		15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	LGALS2	P05162	132 aa		15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ICAM3	P32942	547 aa		15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	MCM5	P33992	734 aa		15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	SEC23A	Q15436	765 aa		15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	MTA3	Q9BTC8	594 aa		15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	PRC1	O43663	620 aa		15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	DGKI	O75912	1065 aa		15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	SNHG28	P0DPA3	235 aa		15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	NBL1	P41271	181 aa		15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ANAPC15	P60006	121 aa		15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	LPIN1	Q14693	890 aa		15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	RGS22	Q8NE09	1264 aa		15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	IWS1	Q96ST2	819 aa		15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	BACH2	Q9BYV9	841 aa		15.92	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	BRD1	O95696	1058 aa		15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	PSMA5	P28066	241 aa		15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ARHGAP4	P98171	946 aa		15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	SP4	Q02446	784 aa		15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ZBTB33	Q86T24	672 aa		15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	SUSD6	Q92537	303 aa		15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	RMDN1	Q96DB5	314 aa		15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	TMEM87B	Q96K49	555 aa		15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		15.91	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ERICH2	A1L162	156 aa		15.9	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	APOBR	Q0VD83	1088 aa		15.9	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		15.9	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		15.9	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		15.9	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		15.9	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	TLE6	Q9H808	572 aa		15.9	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		15.9	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	ABCB11	O95342	1321 aa		15.9	■□□□□ 0.14
CS-231	ENST00000552222	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	ASGR2	P07307	311 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	WEE2	P0C1S8	567 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	ERVFC1	P60507	584 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	ADAM17	P78536	824 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	MGAT3	Q09327	533 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	WTAP	Q15007	396 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	FAM26D	Q5JW98	314 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	PNMA1	Q8ND90	353 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	APBB2	Q92870	758 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	S1PR5	Q9H228	398 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	KAT14	Q9H8E8	782 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	LY9	Q9HBG7	655 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	SENP2	Q9HC62	589 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		15.89	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	PI15	O43692	258 aa		15.88	■□□□□ 0.13

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