RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.92■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.92■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 C2CD4DB7Z1M9 353 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 PI15O43692 258 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 ASGR2P07307 311 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 GNAT1P11488 350 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 TECP42680 631 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 APOBRQ0VD83 1088 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 LLGL2Q6P1M3 1020 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 SORCS3Q9UPU3 1222 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 CDY2AQ9Y6F7 541 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 NEDD4P46934 1319 aa15.91■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 FSCN2O14926 492 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 TGFB3P10600 412 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 MTMR3Q13615 1198 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 NPAS4Q8IUM7 802 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 PNMA1Q8ND90 353 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 DNAJB3Q8WWF6 145 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 USP26Q9BXU7 913 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 POMKQ9H5K3 350 aa15.9■□□□□ 0.14
CS-230ENST00000551968 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 SP4Q02446 784 aa15.89■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 MARCH8Q5T0T0 291 aa15.89■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 MCTP2Q6DN12 878 aa15.89■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa15.89■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 UBALD2Q8IYN6 164 aa15.89■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 MIER1Q8N108 512 aa15.89■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 FEZF2Q8TBJ5 459 aa15.89■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 DCTPP1Q9H773 170 aa15.89■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 HIDE1A8MVS5 230 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 WEE2P0C1S8 567 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 CCND2P30279 289 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 PLPP4Q5VZY2 271 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 METTL7BQ6UX53 244 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 KIAA2013Q8IYS2 634 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 STAG2Q8N3U4 1231 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 FAM227BQ96M60 508 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 TMX1Q9H3N1 280 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 TTC41PQ6P2S7 1318 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 NRCAMQ92823 1304 aa15.88■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 A0A0D9SFI3 127 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 CCER2I3L3R5 266 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 FGF18O76093 207 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 NPR3P17342 541 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 RTEL1Q9NZ71 1219 aa15.87■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 CEP250Q9BV73 2442 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 SCG2P13521 617 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 CLCN5P51795 746 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 UBE3AQ05086 875 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 TMEM62Q0P6H9 643 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 PPFIA1Q13136 1202 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 ANGPT1Q15389 498 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 GRIK4Q16099 956 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 KANK3Q6NY19 840 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 TAF2Q6P1X5 1199 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 DGKHQ86XP1 1220 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 FLCNQ8NFG4 579 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 AMNQ9BXJ7 453 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 MFSD1Q9H3U5 465 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 TMEM260Q9NX78 707 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 PADI3Q9ULW8 664 aa15.86■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 TPRP12270 2363 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 MGEA5O60502 916 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 MS4A1P11836 297 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 MARK3P27448 753 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 TMEM266Q2M3C6 531 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 ASPRV1Q53RT3 343 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 FAM102BQ5T8I3 360 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 MTMR8Q96EF0 704 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 LIMD1Q9UGP4 676 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 NR2E1Q9Y466 385 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.85■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 STAG3L1P0CL83 205 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 IGBP1P78318 339 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 NEDD9Q14511 834 aa15.84■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CS-230ENST00000551968 CCDC105Q8IYK2 499 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms