RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531500.5

RBM25-209, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 3

Gene RBM25, Length 1,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-209	ENST00000531500	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-209	ENST00000531500	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-209	ENST00000531500	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-209	ENST00000531500	PCYT2	Q99447	389 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-209	ENST00000531500	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-209	ENST00000531500	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-209	ENST00000531500	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-209	ENST00000531500	SETD4	Q9NVD3	440 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-209	ENST00000531500	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-209	ENST00000531500	TRPC6	Q9Y210	931 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-209	ENST00000531500	NRCAM	Q92823	1304 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RBM25-209	ENST00000531500	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	POTEB3	A0JP26	581 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	KIF28P	B7ZC32	967 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	ITGB8	P26012	769 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	CYP2C18	P33260	490 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	TRAPPC10	P48553	1259 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	PPFIA1	Q13136	1202 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	PTK7	Q13308	1070 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF174	Q15697	407 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	TTC38	Q5R3I4	469 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	MFSD5	Q6N075	450 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	POTEB	Q6S5H4	581 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	RDM1	Q8NG50	284 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	GDF15	Q99988	308 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	TREH	O43280	583 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	HBP1	O60381	514 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	INSRR	P14616	1297 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	TXK	P42681	527 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	CCL23	P55773	120 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	IGBP1	P78318	339 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	FPGS	Q05932	587 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	PLCB4	Q15147	1175 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	GRIK4	Q16099	956 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	CAGE1	Q8TC20	777 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	HAS1	Q92839	578 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	WNT7A	O00755	349 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	BMP8B	P34820	402 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	PPP2R5C	Q13362	524 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41	6e-7	■■□□□ 14.1
RBM25-209	ENST00000531500	HIC1	Q14526	733 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	PITPNM1	O00562	1244 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	IQCF3	P0C7M6	154 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	CSF2RA	P15509	400 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	SYT1	P21579	422 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	HOXC8	P31273	242 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	THPO	P40225	353 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	EPHA7	Q15375	998 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	SERINC5	Q86VE9	423 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	SCLY	Q96I15	445 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	FAM167A	Q96KS9	214 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	MTMR9	Q96QG7	549 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	VAV3	Q9UKW4	847 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	EML1	O00423	815 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	OAT	P04181	439 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	OR52Z1	P0C646	297 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	CKB	P12277	381 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	SELP	P16109	830 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	ATP4A	P20648	1035 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	TEC	P42680	631 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	PSMC5	P62195	406 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	ADAM17	P78536	824 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	NBR1	Q14596	966 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	BRAP	Q7Z569	592 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	RSPH3	Q86UC2	560 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM25-209	ENST00000531500	BANK1	Q8NDB2	785 aa		12.48	□□□□□ -0.41

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