RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 HPSEQ9Y251 543 aa25.51■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM150BA6NC51 233 aa25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.672e-6■■■■□ 20
TSNARE1-208ENST00000524325 PLCG1P19174 1290 aa25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMC6P62333 389 aa25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 PPTC7Q8NI37 304 aa25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 ERMNQ8TAM6 284 aa25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 CCSER1Q9C0I3 900 aa25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 ATG7O95352 703 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF286BP0CG31 522 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 RARBP10826 455 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 SFNP31947 248 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 AP5M1Q9H0R1 490 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 CTAGE5O15320 804 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 PSAPP07602 524 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF862O60290 1169 aa25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 MMP3P08254 477 aa25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 MARK3P27448 753 aa25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 RPA1P27694 616 aa25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 TXLNAP40222 546 aa25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 SYKP43405 635 aa25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 ENGASEQ8NFI3 743 aa25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 DACT1Q9NYF0 836 aa25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 LONRF3Q496Y0 759 aa25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 E9PMD0 336 aa25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 CHMP4BP1P59074 171 aa25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 NAALADL2Q58DX5 795 aa25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 STAMQ92783 540 aa25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 GLG1Q92896 1179 aa25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 CALML4Q96GE6 196 aa25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.672e-6■■■■■ 29.4
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF302Q9NR11 478 aa25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF202O95125 648 aa25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP4AP20648 1035 aa25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 LHX8Q68G74 356 aa25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 SERTAD1Q9UHV2 236 aa25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa25.45■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa25.45■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 A6NJR5 290 aa25.45■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 CCL5P13501 91 aa25.45■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM119Q4V9L6 283 aa25.45■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 GNASQ5JWF2 1037 aa25.45■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 PDXDC2PQ6P474 469 aa25.45■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa25.45■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 RDM1Q8NG50 284 aa25.45■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF208Q9H0X6 261 aa25.45■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.45■■□□□ 1.67
TSNARE1-208ENST00000524325 LGALS2P05162 132 aa25.45■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 STAT6P42226 847 aa25.45■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 STAT5BP51692 787 aa25.45■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 E2F4Q16254 413 aa25.45■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.45■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 MYL3P08590 195 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 GJA9P57773 515 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMC5P62195 406 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 DEFB118Q96PH6 123 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 Q9Y3F1 56 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAMTS4O75173 837 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 PPFIA4O75335 1185 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 DGKDQ16760 1214 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 HYIQ5T013 277 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 PLA2G4FQ68DD2 849 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 AZI2Q9H6S1 392 aa25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKCEQ02156 737 aa25.43■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.43■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 LGR5O75473 907 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 MCM6Q14566 821 aa25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1-208ENST00000524325 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
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