RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524226.5

PCM1-222, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCM1, Length 5,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-222	ENST00000524226	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CABP7	Q86V35	215 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PROM2	Q8N271	834 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	AK8	Q96MA6	479 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TRPC6	Q9Y210	931 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		2.82	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TLDC2	A0PJX2	215 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	STXBP3	O00186	592 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	IKBKB	O14920	756 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	SPOP	O43791	374 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	GDF11	O95390	407 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MAP2K2	P36507	400 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	SLC12A2	P55011	1212 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	UBXN1	Q04323	297 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	DEUP1	Q05D60	604 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ASPH	Q12797	758 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PPP2R5D	Q14738	602 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	GRIK5	Q16478	980 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PKN1	Q16512	942 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	SHC4	Q6S5L8	630 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	KCTD1	Q719H9	257 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ZNF384	Q8TF68	577 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	HAUS1	Q96CS2	278 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MRI	Q9BWK5	157 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ELP3	Q9H9T3	547 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	COL4A1	P02462	1669 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	FLOT1	O75955	427 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TNFAIP3	P21580	790 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ELF1	P32519	619 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	NOG	Q13253	232 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	BRD3	Q15059	726 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	NSMF	Q6X4W1	530 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	SV2B	Q7L1I2	683 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	WHAMM	Q8TF30	809 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	SEPT8	Q92599	483 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	OTUD5	Q96G74	571 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	IWS1	Q96ST2	819 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CUEDC2	Q9H467	287 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	TAF1	P21675	1872 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PSMD14	O00487	310 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	ZBTB5	O15062	677 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	GNA14	O95837	355 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MYL1	P05976	194 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	P4HA1	P13674	534 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PTGS1	P23219	599 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	MMP14	P50281	582 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CACNB3	P54284	484 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RHBDL3	P58872	404 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	PTPA	Q15257	358 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	LONRF3	Q496Y0	759 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	SARM1	Q6SZW1	724 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	RNF180	Q86T96	592 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	FBXO11	Q86XK2	927 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PCM1-222	ENST00000524226	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		2.81	□□□□□ -1.96

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