RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 CYP4F3Q08477 520 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 SQSTM1Q13501 440 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 AUHQ13825 339 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 CEP128Q6ZU80 1094 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 JMYQ8N9B5 988 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 DHRS1Q96LJ7 313 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 TCFL5Q9UL49 500 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 IRAK3Q9Y616 596 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 SLC12A7Q9Y666 1083 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 C4BP0C0L5 1744 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 KDRP35968 1356 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 ITGB4P16144 1822 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM82A0PJX8 343 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 N4BP3O15049 544 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 FAM153BP0C7A2 387 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 PNLIPP16233 465 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 CD247P20963 164 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 GRIA2P42262 883 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF445P59923 1031 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 NFIXQ14938 502 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 NCAPHQ15003 741 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 MORC1Q86VD1 984 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 C7orf61Q8IZ16 206 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 PANK1Q8TE04 598 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 HHIPL1Q96JK4 782 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 CFAP53Q96M91 514 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 SYT17Q9BSW7 474 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 GP6Q9HCN6 339 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PQU0 124 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 SYN1P17600 705 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 VIPR1P32241 457 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 CTSKP43235 329 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 YBX1P67809 324 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 TCEAL1Q15170 157 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 NFE2L2Q16236 605 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 BBS9Q3SYG4 887 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF662Q6ZS27 426 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 BRF1Q92994 677 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 MCMBPQ9BTE3 642 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 CNTD2Q9H8S5 307 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 NUDCQ9Y266 331 aa5.54□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 ABLIM1O14639 778 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 SASH1O94885 1247 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB7AO95365 584 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 SYPP08247 313 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 PHKG2P15735 406 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 EPHB3P54753 998 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 ERVFRD-1P60508 538 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 TGFB2P61812 414 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 GPR162Q16538 588 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 ZPBP2Q6X784 338 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 CXorf38Q8TB03 319 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 PLCD4Q9BRC7 762 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 POLKQ9UBT6 870 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 UBR3Q6ZT12 1888 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa5.53□□□□□ -1.52
HDAC2-216ENST00000523628 MRC1P22897 1456 aa5.52□□□□□ -1.53
HDAC2-216ENST00000523628 A0A087WZG4 1122 aa5.52□□□□□ -1.53
HDAC2-216ENST00000523628 ESYT3A0FGR9 886 aa5.52□□□□□ -1.53
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.52□□□□□ -1.53
HDAC2-216ENST00000523628 ARNTLO00327 626 aa5.52□□□□□ -1.53
HDAC2-216ENST00000523628 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
HDAC2-216ENST00000523628 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
HDAC2-216ENST00000523628 SIGLEC6O43699 453 aa5.52□□□□□ -1.53
HDAC2-216ENST00000523628 FKTNO75072 461 aa5.52□□□□□ -1.53
HDAC2-216ENST00000523628 PRAMEF1O95521 474 aa5.52□□□□□ -1.53
HDAC2-216ENST00000523628 ITGAVP06756 1048 aa5.52□□□□□ -1.53
HDAC2-216ENST00000523628 SDHBP21912 280 aa5.52□□□□□ -1.53
HDAC2-216ENST00000523628 RTP1P59025 263 aa5.52□□□□□ -1.53
HDAC2-216ENST00000523628 SF1Q15637 639 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms