RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.07■■■□□ 2.08
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LAPTM4B-202ENST00000517924 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa28.07■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa28.06■■■□□ 2.08
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LAPTM4B-202ENST00000517924 KCNJ6P48051 423 aa28.06■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 SCRN1Q12765 414 aa28.06■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 DBF4BQ8NFT6 615 aa28.06■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.06■■■□□ 2.08
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LAPTM4B-202ENST00000517924 ADGRE1Q14246 886 aa28.05■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.04■■■□□ 2.08
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LAPTM4B-202ENST00000517924 ATG7O95352 703 aa28.04■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 INSRRP14616 1297 aa28.04■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLCB4Q15147 1175 aa28.04■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 NPY5RQ15761 445 aa28.04■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRR16Q569H4 304 aa28.04■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP28.04■■■□□ 2.082e-8■■■■■ 27.3
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LAPTM4B-202ENST00000517924 BICD2Q8TD16 824 aa28.04■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa28.04■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 AZI2Q9H6S1 392 aa28.04■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 TUBE1Q9UJT0 475 aa28.04■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 DEXIO95424 95 aa28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 CHRNA1P02708 482 aa28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 STAT5BP51692 787 aa28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 AK2P54819 239 aa28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANAPC15P60006 121 aa28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 IKBKEQ14164 716 aa28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 MCTP2Q6DN12 878 aa28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 USP38Q8NB14 1042 aa28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 LENG9Q96B70 501 aa28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF577Q9BSK1 485 aa28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 CERS4Q9HA82 394 aa28.03■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa28.02■■■□□ 2.08
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LAPTM4B-202ENST00000517924 CAND2O75155 1236 aa28.02■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 CIITAP33076 1130 aa28.02■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABHD15Q6UXT9 468 aa28.02■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRPC6Q9Y210 931 aa28.02■■■□□ 2.08
LAPTM4B-202ENST00000517924 EVPLQ92817 2033 aa28.01■■■□□ 2.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 TAP1Q03518 808 aa28.01■■■□□ 2.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM26DQ5JW98 314 aa28.01■■■□□ 2.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa28.01■■■□□ 2.07
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LAPTM4B-202ENST00000517924 IL17RAQ96F46 866 aa28.01■■■□□ 2.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.01■■■□□ 2.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 REV3LO60673 3130 aa28.01■■■□□ 2.07
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LAPTM4B-202ENST00000517924 M0R2N6 131 aa28■■■□□ 2.07
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LAPTM4B-202ENST00000517924 TLL1O43897 1013 aa28■■■□□ 2.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 PFKFB2O60825 505 aa28■■■□□ 2.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 LARGE1O95461 756 aa28■■■□□ 2.07
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LAPTM4B-202ENST00000517924 ZBED2Q9BTP6 218 aa27.98■■■□□ 2.07
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LAPTM4B-202ENST00000517924 EFCAB14O75071 495 aa27.97■■■□□ 2.07
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LAPTM4B-202ENST00000517924 GHRP10912 638 aa27.97■■■□□ 2.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 DAGLBQ8NCG7 672 aa27.97■■■□□ 2.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPM1EQ8WY54 764 aa27.97■■■□□ 2.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF302Q9NR11 478 aa27.97■■■□□ 2.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa27.96■■■□□ 2.07
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYOCDQ8IZQ8 938 aa27.96■■■□□ 2.07
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