RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM209Q96SK2 561 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 BOCQ9BWV1 1114 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 KCNH7Q9NS40 1196 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 BTBD7Q9P203 1132 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 B4GALT6Q9UBX8 382 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTPDC1A2A3K4 754 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 PDE8AO60658 829 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 AOAHP28039 575 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 SDHAP31040 664 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 MC4RP32245 332 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 FLT3P36888 993 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 DSG1Q02413 1049 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 PHF19Q5T6S3 580 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 VASNQ6EMK4 673 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 RNF180Q86T96 592 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM151BQ8IW70 566 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPM1KQ8N3J5 372 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 TTLL6Q8N841 843 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 LINC01356Q8N9X3 169 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 CABP5Q9NP86 173 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 DLL4Q9NR61 685 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRIM13O60858 407 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 KRT37O76014 449 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 MPIG6BO95866 241 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 MMEP08473 750 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 COL6A1P12109 1028 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF28P17035 718 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 RPL13P26373 211 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 NEK4P51957 841 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 HERVK_113P62684 666 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 PFKPQ01813 784 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 SKIDA1Q1XH10 827 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 CATSPEREQ5SY80 951 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ASB15Q8WXK1 588 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 WNK4Q96J92 1243 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.78□□□□□ -1.64
RNU6-410P-201ENST00000517006 HIP1RO75146 1068 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 IL18BPO95998 194 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 F2P00734 622 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 STAT3P40763 770 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 LCE3BQ5TA77 95 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 EP400NLQ6ZTU2 488 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 KIF18BQ86Y91 864 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 CARFQ8N187 725 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 NXPE1Q8N323 547 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 CLIC6Q96NY7 704 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 WRNIP1Q96S55 665 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 KCND1Q9NSA2 647 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 NTMQ9P121 344 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZFP69BQ9UJL9 534 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAPRE3Q9UPY8 281 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 CADPSQ9ULU8 1353 aa4.77□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 FOXP2O15409 715 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTGS1P23219 599 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 MASP1P48740 699 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLURP1P55000 103 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 TAF7LQ5H9L4 462 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 KIAA1958Q8N8K9 716 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPATA25Q9BR10 227 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 AMNQ9BXJ7 453 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 OXSMQ9NWU1 459 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 CROTQ9UKG9 612 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 H7C1D1 291 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 KNG1P01042 644 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 VIL1P09327 827 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 GLRBP48167 497 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 KIF11P52732 1056 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM132BQ14DG7 1078 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 SIAH1Q8IUQ4 282 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 AHI1Q8N157 1196 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 STPG3Q8N7X2 389 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 SYT8Q8NBV8 401 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 SMC1BQ8NDV3 1235 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 CHTF18Q8WVB6 975 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 GBP4Q96PP9 640 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-410P-201ENST00000517006 KCNC2Q96PR1 638 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms