RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 MARCH6O60337 910 aa22.79■■□□□ 1.24
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USP53-208ENST00000514305 GH1P01241 217 aa22.79■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 CYP2C9P11712 490 aa22.79■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 NEDD9Q14511 834 aa22.79■■□□□ 1.24
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USP53-208ENST00000514305 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.78■■□□□ 1.24
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USP53-208ENST00000514305 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.77■■□□□ 1.24
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USP53-208ENST00000514305 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.77■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.77■■□□□ 1.24
USP53-208ENST00000514305 KIF28PB7ZC32 967 aa22.76■■□□□ 1.23
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USP53-208ENST00000514305 RETREG2Q8NC44 543 aa22.76■■□□□ 1.23
USP53-208ENST00000514305 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
USP53-208ENST00000514305 SDF4Q9BRK5 362 aa22.76■■□□□ 1.23
USP53-208ENST00000514305 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.76■■□□□ 1.23
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USP53-208ENST00000514305 TBX3O15119 743 aa22.75■■□□□ 1.23
USP53-208ENST00000514305 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.75■■□□□ 1.23
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USP53-208ENST00000514305 RFC2P35250 354 aa22.75■■□□□ 1.23
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USP53-208ENST00000514305 ARP10275 920 aa22.71■■□□□ 1.23
USP53-208ENST00000514305 ZNF174Q15697 407 aa22.71■■□□□ 1.23
USP53-208ENST00000514305 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
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