RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510920.5

FAM200B-217, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 3

Gene FAM200B, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-217	ENST00000510920	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAM200B-217	ENST00000510920	C8orf76	Q96K31	380 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM200B-217	ENST00000510920	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
FAM200B-217	ENST00000510920	BACH2	Q9BYV9	841 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM200B-217	ENST00000510920	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAM200B-217	ENST00000510920	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAM200B-217	ENST00000510920	MSH4	O15457	936 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	TREH	O43280	583 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	CHMP2A	O43633	222 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	MARCH6	O60337	910 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	LGR5	O75473	907 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	CCNE2	O96020	404 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	MMP1	P03956	469 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	MCM2	P49736	904 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	IGBP1	P78318	339 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	KRT76	Q01546	638 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	NR5A1	Q13285	461 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920		Q4G0T1	1027 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	LENG9	Q96B70	501 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	ZNF302	Q9NR11	478 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	LAMA3	Q16787	3333 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	FGB	P02675	491 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	PSAP	P07602	524 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	SELP	P16109	830 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	RFC2	P35250	354 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	THPO	P40225	353 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	HIC1	Q14526	733 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	GRIK4	Q16099	956 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	TMEM240	Q5SV17	173 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	PCYT2	Q99447	389 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	EDIL3	O43854	480 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	ATG7	O95352	703 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	PFKM	P08237	780 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	CKB	P12277	381 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	ACTN1	P12814	892 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	CYP3A7	P24462	503 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	SLC26A2	P50443	739 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	PLCB4	Q15147	1175 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	SLC5A5	Q92911	643 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	GJA10	Q969M2	543 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	RIT2	Q99578	217 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	SLC37A4	O43826	429 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	CTSH	P09668	335 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	INSRR	P14616	1297 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	HOXC8	P31273	242 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	JAK3	P52333	1124 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	WNT8B	Q93098	351 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAM200B-217	ENST00000510920	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.86	□□□□□ -0.19

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