RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495904.1

VSTM2A-207, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 3

Gene VSTM2A, Length 865 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-207ENST00000495904 NOD1Q9Y239 953 aa24.14■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 TELO2Q9Y4R8 837 aa24.14■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 CD4P01730 458 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 MCM7P33993 719 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 FAAP100Q0VG06 881 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 PPP2R5CQ13362 524 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 ZNF302Q9NR11 478 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 KIAA0355O15063 1070 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 MIER3Q7Z3K6 550 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 HAS1Q92839 578 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 PCYT2Q99447 389 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 UNC45AQ9H3U1 944 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 NRCAMQ92823 1304 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 CHMP2AO43633 222 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 B4GALT4O60513 344 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 DEFB123Q8N688 67 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 VAV3Q9UKW4 847 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 TBX21Q9UL17 535 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 STX6O43752 255 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 OR52Z1P0C646 297 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 ZNF174Q15697 407 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 PTGISQ16647 500 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 SWSAP1Q6NVH7 229 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 MTMR9Q96QG7 549 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 LAD1O00515 517 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 WNT7AO00755 349 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 MARK3P27448 753 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 HOXC8P31273 242 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 PPFIA1Q13136 1202 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 BADQ92934 168 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 GJA10Q969M2 543 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 FAM167AQ96KS9 214 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 GABBR1Q9UBS5 961 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 TRPC6Q9Y210 931 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 LTBP2Q14767 1821 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 RAG1P15918 1043 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 ATP8B4Q8TF62 1192 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
VSTM2A-207ENST00000495904 DOCK5Q9H7D0 1870 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 POTEB3A0JP26 581 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 HBP1O60381 514 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 BMP15O95972 392 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 TXKP42681 527 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 PTK7Q13308 1070 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 BFSP2Q13515 415 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 PLCB4Q15147 1175 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 POTEBQ6S5H4 581 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 CAGE1Q8TC20 777 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 HIPK3Q9H422 1215 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 MTMR6Q9Y217 621 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 EPHA7Q15375 998 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 GRIK4Q16099 956 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 NEK9Q8TD19 979 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 RAB34Q9BZG1 259 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 COL1A2P08123 1366 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 PITPNM1O00562 1244 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 TIMP1P01033 207 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 PRPHP41219 470 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 PSMC5P62195 406 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 Q7L0L9 218 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 FERMT3Q86UX7 667 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM2A-207ENST00000495904 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms