RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 NLGN1Q8N2Q7 840 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 CPA5Q8WXQ8 436 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SEC14L1Q92503 715 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 CHAMP1Q96JM3 812 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 ARHGEF4Q9NR80 690 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 FBXL7Q9UJT9 491 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 TRPM2O94759 1503 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 STRCP1A6NGW2 1772 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 C1orf167Q5SNV9 1468 aa4.55□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 CROCC2H7BZ55 1655 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 NPHP3Q7Z494 1330 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 NWD1Q149M9 1564 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PRODHO43272 600 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 FGFR1P11362 822 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC6A11P48066 632 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 RASGRF1Q13972 1273 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 NSMFQ6X4W1 530 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 USP53Q70EK8 1073 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 KRT28Q7Z3Y7 464 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 LINC01356Q8N9X3 169 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 OSBP2Q969R2 916 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 MKL1Q969V6 931 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PRAM1Q96QH2 718 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SPATA9Q9BWV2 254 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 USP35Q9P2H5 1018 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PALD1Q9ULE6 856 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 DCCP43146 1447 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SETD5Q9C0A6 1442 aa4.54□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 UNC13BO14795 1591 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 TRAV20A0A0B4J274 112 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 H7BY64 318 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM13O60858 407 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 INHBBP09529 407 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 CAP1Q01518 475 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 MTERF2Q49AM1 385 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 TTLL10Q6ZVT0 673 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SPATC1Q76KD6 591 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 MILR1Q7Z6M3 343 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 FNIP1Q8TF40 1166 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 KCNC2Q96PR1 638 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 OSBPL2Q9H1P3 480 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PARD6AQ9NPB6 346 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 GPR27Q9NS67 375 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 CLDND1Q9NY35 253 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 NHSL1Q5SYE7 1610 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD28-211ENST00000492895 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa4.53□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 FFAR3O14843 346 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 MSCO60682 206 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 HTRA3P83110 453 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 NFE2L2Q16236 605 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 NTRK3Q16288 839 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 ETV3LQ6ZN32 361 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 DCAF4Q8WV16 495 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 DDX11Q96FC9 970 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 CDIP1Q9H305 208 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 SNTG2Q9NY99 539 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 IQGAP3Q86VI3 1631 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 PTCH1Q13635 1447 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 DIP2AQ14689 1571 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 PHLPP1O60346 1717 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 ABCC11Q96J66 1382 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 UTRNP46939 3433 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 E9PCH4 1651 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 BLACEA4D250 179 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 HGSO14964 777 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 ADCY3O60266 1144 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 DGKIO75912 1065 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 SASH1O94885 1247 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 C8BP07358 591 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 CYP2C8P10632 490 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 C1QTNF8P60827 252 aa4.51□□□□□ -1.69
ANKRD28-211ENST00000492895 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms