RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	CUL4A	Q13619	759 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	KRT32	Q14532	448 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	C2orf27A	Q580R0	203 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	RGMB	Q6NW40	437 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	CTR9	Q6PD62	1173 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	RUFY3	Q7L099	469 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	SV2A	Q7L0J3	742 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	CDCA5	Q96FF9	252 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	CAPNS2	Q96L46	248 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	FEZ1	Q99689	392 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	CORO1B	Q9BR76	489 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	IDI2	Q9BXS1	227 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	RLF	Q13129	1914 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	FLT1	P17948	1338 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	NEDD4	P46934	1319 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	ADM5	C9JUS6	153 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	FOXN1	O15353	648 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	ORC4	O43929	436 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	LDHC	P07864	332 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	ALAS2	P22557	587 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	ADH6	P28332	368 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	BTD	P43251	543 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	NT5C2	P49902	561 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	HUNK	P57058	714 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	PDE4B	Q07343	736 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	TCEA2	Q15560	299 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	C12orf60	Q5U649	245 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	HDX	Q7Z353	690 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	TTC6	Q86TZ1	520 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	TTC9	Q92623	222 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	MTA3	Q9BTC8	594 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	AAAS	Q9NRG9	546 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A1W2PQH9	124 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	GPR25	O00155	361 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	LARGE1	O95461	756 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	CPA1	P15085	419 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	MX2	P20592	715 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	MCM2	P49736	904 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	AK2	P54819	239 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	PPARA	Q07869	468 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	NCAPH	Q15003	741 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	DLGAP5	Q15398	846 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	CFAP100	Q494V2	611 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	DLK2	Q6UY11	383 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	PDZD3	Q86UT5	571 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	TEKT1	Q969V4	418 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
DCTN1-222	ENST00000492717	NEK1	Q96PY6	1258 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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