RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		29.15	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	WDR64	B1ANS9	1081 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	BACH1	O14867	736 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	TBX3	O15119	743 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	PSAP	P07602	524 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	ATP2B1	P20020	1258 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	ADAM17	P78536	824 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	PLCB4	Q15147	1175 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF302	Q9NR11	478 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	DISC1	Q9NRI5	854 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TTC3-223	ENST00000492275	TREH	O43280	583 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	CHMP2A	O43633	222 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	ATP4A	P20648	1035 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	WNT8B	Q93098	351 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	VAV3	Q9UKW4	847 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	SAMM50	Q9Y512	469 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	SCN5A	Q14524	2016 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	EPHB4	P54760	987 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	CCL23	P55773	120 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	PTK7	Q13308	1070 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	NRCAM	Q92823	1304 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275		H3BQV1	296 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	SFN	P31947	248 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	SLC26A2	P50443	739 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	JAK3	P52333	1124 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	FPGS	Q05932	587 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	PPFIA1	Q13136	1202 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	SERINC5	Q86VE9	423 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	NEMF	O60524	1076 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	GNAT1	P11488	350 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	INSRR	P14616	1297 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	CSF2RA	P15509	400 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	MCM7	P33993	719 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	PPP2R5C	Q13362	524 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF174	Q15697	407 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	GRIK4	Q16099	956 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	MCTP1	Q6DN14	999 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM199	Q8N511	208 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	RDM1	Q8NG50	284 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	MTMR9	Q96QG7	549 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	POTEB3	A0JP26	581 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	EML1	O00423	815 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	PITPNM1	O00562	1244 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	MARCH6	O60337	910 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	RBL2	Q08999	1139 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	BFSP2	Q13515	415 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	CALCRL	Q16602	461 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	POTEB	Q6S5H4	581 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	HSCB	Q8IWL3	235 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	CAGE1	Q8TC20	777 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	SCLY	Q96I15	445 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	TRPC6	Q9Y210	931 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	TRAPPC10	P48553	1259 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	NBR1	Q14596	966 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	UGCG	Q16739	394 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	TTC38	Q5R3I4	469 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	RETREG2	Q8NC44	543 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TTC3-223	ENST00000492275	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF862	O60290	1169 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	IQCF3	P0C7M6	154 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	CKB	P12277	381 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	VWCE	Q96DN2	955 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	HBP1	O60381	514 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	IGBP1	P78318	339 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	29.06	■■■□□ 2.24	7e-7	■□□□□ 10
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	EVPL	Q92817	2033 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24

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