RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 NPAS4Q8IUM7 802 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 UBALD2Q8IYN6 164 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 CRIPAKQ8N1N5 446 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 GPR20Q99678 358 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 APOL5Q9BWW9 433 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 S1PR5Q9H228 398 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 MTMR3Q13615 1198 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 ASPRV1Q53RT3 343 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 TAF2Q6P1X5 1199 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 METTL7BQ6UX53 244 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 RSPH3Q86UC2 560 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 DGKHQ86XP1 1220 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 TELO2Q9Y4R8 837 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 NRCAMQ92823 1304 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 FSD2A1L4K1 749 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 CD52P31358 61 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 TECP42680 631 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 ANKRD54Q6NXT1 300 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 SYCE2Q6PIF2 218 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 TBC1D10CQ8IV04 446 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 AMNQ9BXJ7 453 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 KRT37O76014 449 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 STAG3L1P0CL83 205 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 SRGAP2BP0DMP2 458 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 PCP11498 1178 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 ERVFC1P60507 584 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 SP4Q02446 784 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 UBE3AQ05086 875 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 NEDD9Q14511 834 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 FCHSD1Q86WN1 690 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 DNAJB3Q8WWF6 145 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 RMDN1Q96DB5 314 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 KAT14Q9H8E8 782 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 NR2E1Q9Y466 385 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 NEDD4P46934 1319 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 SCG2P13521 617 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 PPFIA1Q13136 1202 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 SEMA3FQ13275 785 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 GNPTABQ3T906 1256 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 LLGL2Q6P1M3 1020 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 ESR2Q92731 530 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 FTHL17Q9BXU8 183 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 HELLSQ9NRZ9 838 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 CDH22Q9UJ99 828 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 TUBE1Q9UJT0 475 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 C2CD4DB7Z1M9 353 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 FGF18O76093 207 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 CLCN5P51795 746 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 KCNC3Q14003 757 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 FAM227BQ96M60 508 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM260Q9NX78 707 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 LRFN2Q9ULH4 789 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 DOCK5Q9H7D0 1870 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 A0A0D9SFI3 127 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 FSCN2O14926 492 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 POLR2MP0CAP2 368 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 GRIK4Q16099 956 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 PLPP4Q5VZY2 271 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 IQCA1Q86XH1 822 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 THNSL1Q8IYQ7 743 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 SAMD3Q8N6K7 520 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 RTEL1Q9NZ71 1219 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-222ENST00000491867 ATRXP46100 2492 aa16.02■□□□□ 0.15
ATG4B-222ENST00000491867 ZMYM6O95789 1325 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms